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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002457`

染色体: Chr04 坐标: 39369768-39372681 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002457`
名称	SmilChr04G002457
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT22-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39369768 - 39372681 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021585`
GeneID	`131021585`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021585`
原始查询	`LOC131021585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT22-like
产物	homeobox-leucine zipper protein HAT22-like
Arabidopsis	`AT4G37790` (HAT22) Homeobox-leucine zipper protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829935] identity=53.6; qcov=1.17; evalue=1.11e-79; confidence=high
Rice	`Os04g0548700` (Oshox17) - identity=67.8; qcov=0.504; evalue=2.83e-51; confidence=medium
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021585

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806827.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806827.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806827.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806827.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39370391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B76,C20
`Chr4:39370495`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B96,C3,C48,C61
`Chr4:39370495`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B96,C3,C48,C61
`Chr4:39370770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B11,B8,B86
`Chr4:39372164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:39372272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr4:39372350`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A10,B37,B59,B85,C50,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806827.1

240 aa

120

240

Homeodomain

HALZ

PF00046 Homeodomain 97-151 aa PF02183 HALZ 153-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806827.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	97	151	3e-16	59.7	Homeodomain
`XP_057806827.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	153	184	7.1e-08	33.2	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950844.1
TCGATCGGTCAACCATTTTTTATTTCTTCTCATTTAAAATCGAGCTCTACAATGATTTTTTTTTTCATTTTTACTAAGATTCTTGATTATTTTTATTATTCAAACTAATTTTACTTTATTCTTATTTCAGTGAGATTAGAGATATACTACTCTTGAGAATAAAAATACTCAATTTTACATATAATCAATTATGCAAAATAAACGTCACCTAAAAGTATACTTTCTCATAATTTTCCAACCCAAATTCCTTTCCCTTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021585
ATGGGTGTTGATGATGATTCATGCCAAACCCGTCTGGTTCTAGGATTGGGAATTAGGAGCAGCGCAGAGAATTCGAAGAAGTCATTATCATCCTCGCCATCTCTCACTCTCACCCTCTTCGGCGAAACCATTAATAAGAGGGTTGATGTTTGCTCCAACGACAGCGCCGCGTCTTCTCTCTCCAACGCTAGTGTGAAGAGAGAGAGAGAGGTGGGCAGCGAGGAGGTTGATGAAACAGAGAGAGTCTCATCGAGGGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806827.1
MGVDDDSCQTRLVLGLGIRSSAENSKKSLSSSPSLTLTLFGETINKRVDVCSNDSAASSLSNASVKREREVGSEEVDETERVSSRGSDEDDDGSNGRKKLRLTKAQSALLEESFKHHSTLNPKQKQDLAMELKLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVECELLKKCCETLTDENRRLQKELHDLKLAPPLYMKLPAAATLTICPTCERFSSSGGGPAENATKSPFAKPHFYNHFTNPSAAC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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