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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002465`

染色体: Chr04 坐标: 39482654-39487438 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002465`
名称	SmilChr04G002465
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39482654 - 39487438 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021595`
GeneID	`131021595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021595`
原始查询	`LOC131021595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 homolog
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 homolog
Arabidopsis	`AT4G24820` (AT4G24820) 26S proteasome regulatory subunit Rpn7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828585] identity=83.3; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0485000` (OsRpn7) - identity=82; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01399 (PCI); PF10602 (RPN7); PF21154 (RPN7_PSMD6_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806841.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806841.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806841.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806841.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39483088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:39483134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B2
`Chr4:39484597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C84
`Chr4:39486741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:39487060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806841.1

386 aa

193

386

RPN7

PCI

RPN7_PSMD6_C

PF10602 RPN7 63-236 aa PF01399 PCI 277-354 aa PF21154 RPN7_PSMD6_C 363-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806841.1`	Pfam	`PF10602`	RPN7	Repeat	63	236	9.9e-65	218.2	26S proteasome subunit RPN7
`XP_057806841.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	277	354	2.9e-17	63.4	PCI domain
`XP_057806841.1`	Pfam	`PF21154`	RPN7_PSMD6_C	Domain	363	384	8.2e-13	48.3	26S proteasome regulatory subunit RPN7/PSMD6 C-terminal helix

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950858.1
CCATATATAGAGATGGGCTTTAATGTTAACTTTTGCAGGCTTATTATTTCTGAAGACCCCAAAACCCATCTCTCTCTCTTCCCCGCGTCTCTCTCCTCTCCCTCTTGCTCCCTCCTCAAGAAAGCTCTCGTTCGACTAGAAACAAGCACGGAAAAGTTCGTCAATGGAAGGCGAAGAAGGAGTTCAGCAGCCGCAACTTGTGCTCGCGAACAATCTGTTCTTGCTCACTCAGAACGACGTCGACGATATCGAAAAAGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021595
ATGGAAGGCGAAGAAGGAGTTCAGCAGCCGCAACTTGTGCTCGCGAACAATCTGTTCTTGCTCACTCAGAACGACGTCGACGATATCGAAAAAGTCCGCCTCCGCGATGAGGTCTTTAACTTCATCGTCGCCAACGATATGGCTCCGTTGTACGAAACCCTAGTTGCCAACAAGGTTTTGGATTTGGATCAGAAGGCACTTGACTCGATGCGCTCCAAGATCGATGATGAGTTGAAGAAGCTCGAAGAAAAAATTGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806841.1
MEGEEGVQQPQLVLANNLFLLTQNDVDDIEKVRLRDEVFNFIVANDMAPLYETLVANKVLDLDQKALDSMRSKIDDELKKLEEKIADAEENLGESEVREAHLAKSLFYIRIGDKEKALEQLKITEGKTVAVGQKMDLVFYTLQIGFFHMDFDLISKSIDKAKNLFEEGGDWERKNRLKVYEGLYCMSTRNFKKAADLFLDSISTFTTYELFPYDTFIFYTGLTSIISLDRVSLKQKVVDAPEILTVIGKIPYLSDFLNSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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