当前解析结果
SmilChr04G002469| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002469 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002469 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002469 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 39506184 - 39507995 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021599 |
|---|---|
| GeneID | 131021599 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021599 |
| 原始查询 | LOC131021599 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824008]; symbol=AT3G48490; hit=AT3G48490; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824008]; symbol=AT3G48490; hit=AT3G48490; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G48490 (AT3G48490)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824008] identity=33.8; qcov=0.916; evalue=1.05e-09; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021599 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806844.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806844.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806844.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806844.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057806844.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:39506548 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B2,C2 |
Chr4:39506562 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:39506565 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr4:39506732 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B128 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。