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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002476`

染色体: Chr04 坐标: 39597427-39606981 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002476`
名称	SmilChr04G002476
描述	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 10
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39597427 - 39606981 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021607`
GeneID	`131021607`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021607`
原始查询	`LOC131021607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 10
产物	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 10
Arabidopsis	`AT3G48500` (PDE312) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824009] identity=68.6; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0901900` - identity=60.6; qcov=0.622; evalue=1.3e-175; confidence=high
GO	GO:0000427 (plastid-encoded plastid RNA polymerase complex); GO:0003723 (RNA binding); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF28711 (PTAC10_N); PF28712 (PTAC10_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806847.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057806847.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057806847.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057806847.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39597621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:39597647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B139,B46,B8,C6
`Chr4:39597749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:39598229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:39600806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B28,B88,C83
`Chr4:39602296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:39602949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B71,C33,C85
`Chr4:39604703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:39604781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:39606599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806847.1

674 aa

337

674

PTAC10_N

PTAC10_helical

PF28711 PTAC10_N 62-99 aa PF28712 PTAC10_helical 105-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806847.1`	Pfam	`PF28711`	PTAC10_N	Domain	62	99	2.6e-21	75.4	PTAC10 N-terminal domain
`XP_057806847.1`	Pfam	`PF28712`	PTAC10_helical	Domain	105	142	1.5e-22	80.0	PTAC10 helical bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950864.1
AAATCGACTCCCATTTCATAACTAACAAAACTAACTTTATCCACTGAAAAACCCCTATCCCAAACAACAGTCCCACCCAAACCCCCAAAATGCAAACCCTCTCCTCCTTCACCACCTTCCTTCCCCTCCCACCAAAACCCCTTCTTAAACCCCACAAATCCATCAAGCCCTTCAAGTTGAAGCCCCATCTCCTCCGCTCCTACTCCTCTGACGAGTACCCGGTCGGCGACGACGACGCCTTTCTCGCCTCCTTCGGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021607
ATGCAAACCCTCTCCTCCTTCACCACCTTCCTTCCCCTCCCACCAAAACCCCTTCTTAAACCCCACAAATCCATCAAGCCCTTCAAGTTGAAGCCCCATCTCCTCCGCTCCTACTCCTCTGACGAGTACCCGGTCGGCGACGACGACGCCTTTCTCGCCTCCTTCGGCCCCAAGGAGAAGGAGTCCGAAGAGGAAGCTCGGAGAAGGAACTGGATTGAGAGGGGCTGGGCTCCCTGGGAAGAAATTCTCACACCCGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806847.1
MQTLSSFTTFLPLPPKPLLKPHKSIKPFKLKPHLLRSYSSDEYPVGDDDAFLASFGPKEKESEEEARRRNWIERGWAPWEEILTPEADFARKSLNEGEEVPLQTPEAIEAFKMLTPKYRKQKAAEMGLTEDEYFVKQFEIKGDIPEPLEPLWSGPLVLGLVPPRDWPPRGWEVDREELEFIRGAHKFFSALRVDPEKVEERLEKGTEMEDMCLERYNMFLKQYNEWVEANRDRLEEESYKYDQDYYPGRRKRGKDYNEEM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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