当前解析结果
SmilChr01G001894| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001894 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001894 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001894 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 34056963 - 34060942 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021616 |
|---|---|
| GeneID | 131021616 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021616 |
| 原始查询 | LOC131021616 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021616 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806860.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057806860.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806860.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806860.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806860.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:34058153 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:34060128 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B72 |
Chr1:34060131 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B72,C23 |
Chr1:34060136 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B72 |
Chr1:34060200 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B114,B127 |
Chr1:34060206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,C21 |
Chr1:34060218 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B53 |
Chr1:34060252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B114,B127,C49 |
Chr1:34060285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B137,C26,C49,C79 |
Chr1:34060287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B53 |
Chr1:34060287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr1:34060300 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B69,C12,C56,C57,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。