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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002533`

染色体: Chr04 坐标: 40429086-40434077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002533`
名称	SmilChr04G002533
描述	probable methyltransferase PMT27
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40429086 - 40434077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021659`
GeneID	`131021659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021659`
原始查询	`LOC131021659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase PMT27
产物	probable methyltransferase PMT27
Arabidopsis	`AT3G51070` (AT3G51070) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824271] identity=54.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0712800` (OsSTA181) - identity=57; qcov=0.831; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11); PF13649 (Methyltransf_25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057806892.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057806892.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806892.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806892.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40430740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:40431026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A22,C4,C49
`Chr4:40431120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,D2
`Chr4:40431504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:40431968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:40432283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B75,B95,D6
`Chr4:40432657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr4:40433444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:40433487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:40433742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:40433780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B139,C18,C22,C27
`Chr4:40433788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806892.1

872 aa

436

872

Methyltransf_29

Methyltransf_25

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 355-860 aa PF13649 Methyltransf_25 473-565 aa PF08241 Methyltransf_11 474-568 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806892.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	355	860	1.3e-229	763.7	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057806892.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	473	565	5.3e-09	37.4	Methyltransferase domain
`XP_057806892.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	474	568	7.9e-12	46.4	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950909.1
TGGGAAAAGAATGACAAACCTTAGTGATTCCTATGCATAGTATGCACAAGGAATACCAAAGGAATGGAATTGTGATTCTTTGTTTAATTCAATTCCTATAATTGGTAGCTAGAAATAAAGTTTAGGAATGAAATGAAATTATTTTATTTTATTAATATCAATCCATGTATATGATAGTGTAATATATTGCGTCAATTTCAATCCAGATATTAGACTATTGCTTATATAAAGTTGATAATATTTTATTTTTTCTAAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021659
ATGGCCTCAGGGAAAACTCGCGCCACAAAACGATCCTCGACAACTTCTAGTTATTCATCAGCAACCTCAATCGTAATCCTCGTAGGATTATCTGTATTAGGTTTATGGCTGCTGACCTCCAATTCCTTCACACCATCGCAGCCCCCCGCCACCAAAGCTCCAACCTCCATAGGCCATACTCATCACTCACACGTGCTCCCACAAACTCGCCAAAATGAAAACGACCCCTCTTCTATTTCTGATTCTGATGATGCACTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806892.1
MASGKTRATKRSSTTSSYSSATSIVILVGLSVLGLWLLTSNSFTPSQPPATKAPTSIGHTHHSHVLPQTRQNENDPSSISDSDDALLIQPETNIENDHTHTDKTFKTEAILTDHVDHQDTKASQDNNHAAEEHDKQAALETQTSEESSMTQKEEIIQETPHSETKMETNDAEDVSAEAGSLTQSSNTTQNQISDEDQQRRIDEHQQREDEQKQQEGQEAQSADPNGAISHDQIQHDEAPIHSHQDGSSSQETDKPHAQAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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