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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002567`

染色体: Chr04 坐标: 40980378-40984410 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002567`
名称	SmilChr04G002567
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40980378 - 40984410 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021679`
GeneID	`131021679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021679`
原始查询	`LOC131021679`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 homolog A-like
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 homolog A-like
Arabidopsis	`AT5G09900` (EMB2107) 26S proteasome regulatory subunit, putative (RPN5) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830850] identity=80.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0851300` (OsRpn5) - identity=81.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex); GO:0031595 (nuclear proteasome complex)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01399 (PCI); PF18098 (RPN5_C); PF22241 (PSMD12-CSN4_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806920.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806920.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806920.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806920.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40981716`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr4:40981716`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr4:40981719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:40981769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:40981947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:40982755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:40983115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr4:40983927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806920.1

442 aa

221

442

PSMD12-CSN4_N

PCI

RPN5_C

PF22241 PSMD12-CSN4_N 12-191 aa PF22241 PSMD12-CSN4_N 211-249 aa PF01399 PCI 333-399 aa PF18098 RPN5_C 405-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806920.1`	Pfam	`PF22241`	PSMD12-CSN4_N	Repeat	12	191	1.6e-78	264.0	PSMD12/CSN4, N-terminal
`XP_057806920.1`	Pfam	`PF22241`	PSMD12-CSN4_N	Repeat	211	249	1.6e-78	264.0	PSMD12/CSN4, N-terminal
`XP_057806920.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	333	399	5.9e-16	59.2	PCI domain
`XP_057806920.1`	Pfam	`PF18098`	RPN5_C	Domain	405	437	6.9e-12	46.0	26S proteasome regulatory subunit RPN5 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950937.1
GGGGCATTTAATGTTATTTTCAAATTGTGTAGGGGTCATTTAGTAGGTAAGAAGAACTGCCCCTGTTGTTCTTGAAGTGTCCCCTCTTCCAAGAAATTCGATCCTATTCAGAAAACGGAAAATATATAAAAAACCAAAAAAGGAAAATTAGCTCAGCACAGTACGACACCTTTCAACTCTCCCCTATCTCGCTCTCTAGGGTTTCATTCGCTGCATCAACCTTCTCTGATCCTTGATTGCAATTCACTCAAAATGGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021679
ATGGAAAATGGAGGGACCAGTTTGGAGGCAAAAATAGAGGCGTTGCTCAATGTGGAGAAACAGATGAGACAAGCCGGCGACGTGGCAGGAACAAGAAAGGCTGTCACTGATATTCTACAACTTTGCCTCGATGCCGGCTCGTGGGCGACGCTCAACGAGCAGATTGTGCTTATTTCCAAGCGCCGGGGACAGTTGAAGCAGGCTGTTCAAGCAATGGTCCAACAAGCTATGCAGTATATTGATAAGACACCAGATCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806920.1
MENGGTSLEAKIEALLNVEKQMRQAGDVAGTRKAVTDILQLCLDAGSWATLNEQIVLISKRRGQLKQAVQAMVQQAMQYIDKTPDLDSKIELIKTLNNVSAGKIYVEIERARLIKKLAKIKEEQGQIAEAADLMQEIAVETFGAMAKTEKIAFILEQVRLCLDRQDYVRAQILARKISPRVFEADTSKEKKRKEGESIVEEAPADIPSLLELKRIYYQLMIRYYLHNNDYLEICRCYKSIYEIPSVKEDQAQWIPVLRKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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