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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002585`

染色体: Chr04 坐标: 41264673-41276482 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002585`
名称	SmilChr04G002585
描述	RNA cytidine acetyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41264673 - 41276482 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021699`
GeneID	`131021699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021699`
原始查询	`LOC131021699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA cytidine acetyltransferase 1-like
产物	RNA cytidine acetyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT1G10490` (AT1G10490) GNAT acetyltransferase (DUF699) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837589] identity=70.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0170700` - identity=57.1; qcov=0.498; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000049 (tRNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030686 (90S preribosome); GO:1904812 (rRNA acetylation involved in maturation of SSU-rRNA); GO:1990883 (18S rRNA cytidine N-acetyltransferase activity)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05127 (NAT10_TcmA_helicase); PF08351 (TmcA_N); PF13718 (GNAT_acetyltr_2); PF13725 (tRNA_bind_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806961.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057806961.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806961.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806961.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806961.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41264989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B22,B54,C11,C69
`Chr4:41266475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:41267006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:41267058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:41267538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B98,C80
`Chr4:41268301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B68,C82
`Chr4:41270209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:41271432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B91,C29
`Chr4:41271485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:41271542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:41271648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:41274048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806961.1

1025 aa

512

1025

TmcA_N

NAT10_TcmA_helicase

GNAT_acetyltr_2

tRNA_bind_2

PF08351 TmcA_N 1-200 aa PF05127 NAT10_TcmA_helicase 281-477 aa PF13718 GNAT_acetyltr_2 517-745 aa PF13725 tRNA_bind_2 760-974 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806961.1`	Pfam	`PF08351`	TmcA_N	Domain	1	200	9.3e-21	74.7	tRNA(Met) cytidine acetyltransferase TmcA, N-terminal
`XP_057806961.1`	Pfam	`PF05127`	NAT10_TcmA_helicase	Domain	281	477	4.9e-55	186.9	RNA cytidine acetyltransferase NAT10/TcmA, helicase domain
`XP_057806961.1`	Pfam	`PF13718`	GNAT_acetyltr_2	Family	517	745	5.7e-96	321.0	GNAT acetyltransferase 2
`XP_057806961.1`	Pfam	`PF13725`	tRNA_bind_2	Family	760	974	1e-53	183.2	Possible tRNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950978.1
AGAAATTCTAAGACGGAGCACGCAGAACCCGGTTCGCTAAACCCTAGCCACTAAACCCTCAATCCCTCACCAATTTGCTTTAGAAGAATCTCCCACCAATTTTGAACAGTTAATAATCGTGATTCCACAACCGCCAAATTCTCTCTCGACTGCCGCCGGCCGTCAATTCCGTGAAACATCCAACACCGCCGCAGAAAAGAGGAGCTTGAGAATTAAGGGAAACAATGAGAAAGAAGGTTGACGAACGAATTAGGACCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021699
ATGAGAAAGAAGGTTGACGAACGAATTAGGACCCTAATTGAAAATGGCGTCAAAGCCCGTCATCGCTCCATGTTCGTCATTGTTGGTGATAAGTCACGCGACCAGATTGTGAATTTGCATTTCATGTTGACCAAATCGGTGGTGAAGTCGCGCCCGAAAGTGTTATGGTGCTACAAGGACAAACTCGAGCTTAGCAGTCACAAAAAGAAGCGGGCAAAGCAAGTGAAGAAACTAGCACTAAGGGGCTTATTGGATCCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806961.1
MRKKVDERIRTLIENGVKARHRSMFVIVGDKSRDQIVNLHFMLTKSVVKSRPKVLWCYKDKLELSSHKKKRAKQVKKLALRGLLDPEKVDPFSLFVETAGITYCLYKDSERILGNTFGMCILQDFEALTPNLLARTIETVEGGGLIVLLLRSLSSLTSLYTMVMDVHERFRTESHSRATGRFNERFLLSLASCKSCIVMDDELNILPISSHMKSITPLPVQEDSEGLSEAERELKSLKEQLNGETPVGPLIRKCYTMDQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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