当前解析结果
SmilChr04G002600| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002600 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002600 |
| 描述 | mitochondrial pyruvate carrier 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 41416498 - 41417090 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021713 |
|---|---|
| GeneID | 131021713 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021713 |
| 原始查询 | LOC131021713 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial pyruvate carrier 3-like |
| 产物 | mitochondrial pyruvate carrier 3-like |
| Arabidopsis | AT4G05590 (AT4G05590)pyruvate carrier-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825927] identity=73.7; qcov=0.905; evalue=4.99e-51; confidence=high |
| Rice | Os08g0344300- identity=69.9; qcov=0.981; evalue=1.78e-51; confidence=high |
| GO | GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006850 (pyruvate import into mitochondria) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03650 (MPC) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021713 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057806982.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057806982.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057806982.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057806982.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806982.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:41416779 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A4 |
Chr4:41416779 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A4 |
Chr4:41416781 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr4:41416784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057806982.1PF03650
MPC 2-102 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057806982.1 |
Pfam | PF03650 |
MPC | Repeat | 2 | 102 | 1.3e-36 | 126.1 | Mitochondrial pyruvate carriers |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。