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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002621`

染色体: Chr04 坐标: 41627469-41633803 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002621`
名称	SmilChr04G002621
描述	protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 8, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41627469 - 41633803 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021736`
GeneID	`131021736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021736`
原始查询	`LOC131021736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 8, chloroplastic-like
产物	protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 8%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G64940` (ATH13) ABC2 homolog 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836618] identity=77.8; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0575500` (OsABC1-2) - identity=86.8; qcov=0.812; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0046467 (GO:0046467); GO:1901031 (regulation of response to reactive oxygen species)
KEGG	-
Pfam	PF03109 (ABC1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806999.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057806999.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057806999.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057806999.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41627852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B44,C14,C24
`Chr4:41628496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:41630373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr4:41630391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B28,B58
`Chr4:41630837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:41631125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr4:41631563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:41631708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:41631719`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C22
`Chr4:41631719`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C22
`Chr4:41632279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr4:41632775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B44,C18,C24,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806999.1

762 aa

381

762

ABC1

PF03109 ABC1 261-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806999.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	261	508	3.5e-88	295.6	ABC1 atypical kinase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951016.1
AACAAACAGCCAAATACAGCCCCACTATTCTCAGCCAATAACAGCCCTCCATTTTCCACAACCTCTGCTCCCGCGTCGTGGCACTTGTTCATCCTCAGCCTCACGTTCTGTAAAATGTCTGTTTCCCTAAAAAAATAAACAAAAAATGAAAATAAGAAAATACCAACTTCAATTCTCCACCACCATTCTCCCTCTCTATTTTGCAGATTCTGCAATCTAATAAAGAATGGACCTTTTTGAGTTTTATTGAGGTTCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021736
ATGGCTTCTTTATCAACAAGTGTCACAGTTTTGCGCGAGCCCGTCTTTCTTTCTCCTCAAAACCCCTCTAAAATTCTCAAGGTTTCTCCTTCTAGAATCCATAGCTTTGAACCTCGATGCAGTATCAAAATTTCAGGAACTAGAATTAGGGCTGTTAGGAGAGAGGAAAGTACTGTCCTTGATGAGAGAGACAGAGAATTGAAGAGTAGGCTAAATGGTAATGTGAATGGGAATGGTAGTGGGAACTATGCCTACAGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806999.1
MASLSTSVTVLREPVFLSPQNPSKILKVSPSRIHSFEPRCSIKISGTRIRAVRREESTVLDERDRELKSRLNGNVNGNGSGNYAYSNGSVGSYANGSAKIQQENGNLVKYVNGNSNGNAATKRGVEAVKADEVISEKKKKTVEQIGQEDAWFKQKGQDRVEVSVAPGGRWNRFKTYSTIQRTLEIWGFVVSFIFKAWLSNQKFSYRGGMTEEKKSQRRKVLAKWLKENILRLGPTFIKIGQQFSTRVDILPQEYVDQLSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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