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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002630`

染色体: Chr04 坐标: 41714107-41718628 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002630`
名称	SmilChr04G002630
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41714107 - 41718628 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021743`
GeneID	`131021743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021743`
原始查询	`LOC131021743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 6-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 6-like
Arabidopsis	`AT5G58090` (AT5G58090) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835921] identity=69.6; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0139300` - identity=66.1; qcov=0.925; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057807007.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057807008.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807007.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807007.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41716699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:41716710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C40
`Chr4:41717031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:41717772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B137,B55,B77,C72
`Chr4:41718087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807007.1

515 aa

258

515

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 59-377 aa PF07983 X8 398-469 aa

XP_057807008.1

469 aa

234

469

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 13-331 aa PF07983 X8 352-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807007.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	59	377	2.2e-61	208.8	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057807007.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	398	469	4.5e-15	56.8	X8 domain
`XP_057807008.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	13	331	1.7e-61	209.2	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057807008.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	352	423	4e-15	56.9	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951024.1
AAAGCCCACAATACCACACCAGTATACTTTATCGATTTTCTATACATTTTGACAGCAAAAGTCCCACTTCACTGGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATGCTCGCAACTTCAAAGCAGCCTAGATAACCACTGGCTATTTGCCAATGAATTTATTGCAGCTTTCTCAGCTTATTTGAATTTTTACTTCAAATTTTCAGTTCCAAGATCTAATTTTTATCTCAGTTACTTTGTTTGTTCTCTTCAAAGGA...

XM_057951025.1
TCACTGGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATGCTCGCAACTTCAAAGCAGCCTAGATAACCACTGGCTATTTGCCAATGAATTTATTGCAGCTTTCTCAGCTTATTTGAATTTTTACTTCAAATTTTCAGTTCCAAGATCTAATTTTTATCTCAGTTACTTTGTTTGTTCTCTTCAAAGGAAGAGAGCTCCAAGTAGAGATCTACTGGATATGTTTCGCCTTCTGCTCTTCTTCATAGTCATCTTGATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021743
ATGTTTCGCCTTCTGCTCTTCTTCATAGTCATCTTGCTGTTAGGGCTCGGGTTGAATGGTGCAAATAATCAAAGGATTTTGACTTCAGAATCTGCTGCTGATAGAGATGTTGGGGATGTATCGTCTAGCACAGTCAAAATGAGTACCGTGAGTCATGCCGTTGCAGTGGGAGGGATTGGCGCGAACTGGGGCTCACAATCATCTCACCGGTTGAGACCGGAGATAGTAGTGAGGATGCTAAGGGAGAATGGGATTCAGAA...

LOC131021743
ATGAGTACCGTGAGTCATGCCGTTGCAGTGGGAGGGATTGGCGCGAACTGGGGCTCACAATCATCTCACCGGTTGAGACCGGAGATAGTAGTGAGGATGCTAAGGGAGAATGGGATTCAGAAGGTAAAGCTCTTCGATGCTGATTATGATACACTACGAGCTTTAGGCAGGTCCGGTATTCAGGTTATGGTTGGCATTCCGAATGACATGCTTTCCGATTTAGCCAGTAGTTCGAAGGCTGCTGATAAATGGGTATCGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807007.1
MFRLLLFFIVILLLGLGLNGANNQRILTSESAADRDVGDVSSSTVKMSTVSHAVAVGGIGANWGSQSSHRLRPEIVVRMLRENGIQKVKLFDADYDTLRALGRSGIQVMVGIPNDMLSDLASSSKAADKWVSENVTHHITANNVMIRYVAVGNEPFLQTYNGSFLRTMYPALKNIQDALTKAKLHDQVKITCPNNADVYSTESGLPSGGDFRADIHDYMMPIVKLLNDNGAPFTVNIYPFISLYTEPTFPAEYAFFDGDA...

XP_057807008.1
MSTVSHAVAVGGIGANWGSQSSHRLRPEIVVRMLRENGIQKVKLFDADYDTLRALGRSGIQVMVGIPNDMLSDLASSSKAADKWVSENVTHHITANNVMIRYVAVGNEPFLQTYNGSFLRTMYPALKNIQDALTKAKLHDQVKITCPNNADVYSTESGLPSGGDFRADIHDYMMPIVKLLNDNGAPFTVNIYPFISLYTEPTFPAEYAFFDGDATPLNDGGMTYNNMFDANHDTLVWALQKNGFPNMPIILGEIGWPTDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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