当前解析结果
SmilChr04G002631| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002631 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002631 |
| 描述 | 60S ribosomal protein L10a-3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 41726062 - 41727606 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021744 |
|---|---|
| GeneID | 131021744 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021744 |
| 原始查询 | LOC131021744 |
| 来源 | GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 60S ribosomal protein L10a-3-like |
| 产物 | 60S ribosomal protein L10a-3-like |
| Arabidopsis | AT1G08360 (AT1G08360)Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837356] identity=73.2; qcov=0.974; evalue=4.1e-58; confidence=high |
| Rice | Os01g0860300- identity=72.2; qcov=0.987; evalue=2.73e-57; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00687 (Ribosomal_L1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021744 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057807009.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057807009.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057807009.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807009.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807009.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057807009.1PF00687
Ribosomal_L1 1-118 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057807009.1 |
Pfam | PF00687 |
Ribosomal_L1 | Domain | 1 | 118 | 7.6e-22 | 78.6 | Ribosomal protein L1p/L10e family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。