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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002679`

染色体: Chr04 坐标: 42218840-42222681 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002679`
名称	SmilChr04G002679
描述	uncharacterized SmilChr04G002679
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	42218840 - 42222681 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021785`
GeneID	`131021785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021785`
原始查询	`LOC131021785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836642]; symbol=AT5G65180; hit=AT5G65180; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836642]; symbol=AT5G65180; hit=AT5G65180; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G65180` (AT5G65180) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836642] identity=62.3; qcov=0.948; evalue=4.38e-154; confidence=high
Rice	`Os04g0636700` - identity=58.2; qcov=0.955; evalue=8.9e-141; confidence=high
GO	GO:0000993 (RNA polymerase II complex binding); GO:0016591 (RNA polymerase II, holoenzyme); GO:0031124 (mRNA 3'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF04818 (CID)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807061.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057807061.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057807061.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807061.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:42219447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:42219451`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A25,B1,B122,B136,B22,B30,B46,B61,C29,C4,C5
`Chr4:42219453`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A25,B1,B122,B136,B22,B30,B46,B61,C29,C4,C5
`Chr4:42220010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,A2
`Chr4:42220046`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A24,A7,B102,B117,B140,B24,B35,B36,B55,B7,B91,C23,C29,C42,C6,D10
`Chr4:42220336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr4:42221016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:42221052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C57,C81
`Chr4:42221055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807061.1

381 aa

190

381

CID

PF04818 CID 9-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807061.1`	Pfam	`PF04818`	CID	Repeat	9	121	1.8e-36	125.7	CID domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951078.1
GACATACCCATGGAAAGAATTGCGCTTACATCTCTAAATTTCACAGAATCTTCTTCACACACAACACAATAGACCAAGCTCAATTTTTTGTTACCAAAAAAAGCCAAATCCAATTCCTTATTTGTTTGCGTTTCTTTCTGTATGAATCCCTCCCCATCAATCCCGCTTCCAAAATCCTACCAACAAGATAACTGTTATTAGGGTTTGCAACATAGCTGAAATCACAATTTGTTTCAATTCTATCTACTTTGTCGAAACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021785
ATGAATAGTGTGTTCAGTGAGCAGATACTTGCTGACAAGCTTTCAAAGCTCAATAGCACTCAACAATGCATCGAAACTTTGTCGCATTGGTGTATATTTCACCGTAGCAAAGCAGAGCTAGTGGTTGCAACATGGGACAAACAATTTCGCAGTTCAGATATGGCCCAGAAAGTACCTCTTTTATACCTTGCAAATGATATCCTACAAAACAGCAAGCGTAAAGGAAATGAATTCGTTACCGAGTTCTGGAAAGTTTTACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807061.1
MNSVFSEQILADKLSKLNSTQQCIETLSHWCIFHRSKAELVVATWDKQFRSSDMAQKVPLLYLANDILQNSKRKGNEFVTEFWKVLPSALKEVESKGDDRGKNVVARLVGIWEERRVFGSQAKSLRDAMLGEELPPPLELRKKRSRSVRIVKKDSRSIKTKLSIGGTAEKIVSAFHLVLSEHNNEDEELSKCKSAVHRVKKMEKDVDVALTKAKDPSRKTLAKELEEEESILKQCIEKLKEVENNRVALVAQLRDALHEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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