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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001917`

染色体: Chr01 坐标: 34313384-34317252 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001917`
名称	SmilChr01G001917
描述	mRNA-decapping enzyme-like protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34313384 - 34317252 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021797`
GeneID	`131021797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021797`
原始查询	`LOC131021797`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mRNA-decapping enzyme-like protein
产物	mRNA-decapping enzyme-like protein
Arabidopsis	`AT1G08370` (DCP1) decapping 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837357] identity=57.9; qcov=1.06; evalue=8.89e-127; confidence=high
Rice	`Os07g0249600` (P0021G06.113) - identity=51.4; qcov=1.11; evalue=5.62e-115; confidence=high
GO	GO:0000290 (deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA); GO:0000932 (P-body); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0008047 (enzyme activator activity); GO:0031087 (deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA); GO:0043085 (positive regulation of catalytic activity)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06058 (DCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807074.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807074.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057807074.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057807074.1`
5	P-body	P-body	0.60000	`XP_057807074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34316354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:34316397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B104,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807074.1

367 aa

184

367

DCP1

PF06058 DCP1 18-131 aa

XP_057807080.1

355 aa

178

355

DCP1

PF06058 DCP1 18-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807074.1`	Pfam	`PF06058`	DCP1	Domain	18	131	1.5e-45	154.6	Dcp1-like decapping family
`XP_057807080.1`	Pfam	`PF06058`	DCP1	Domain	18	131	1.4e-45	154.7	Dcp1-like decapping family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951091.1
TGACTAATATGCCCCTAGGCCGAGTTAACAAAAAAAAGGCGAGCAATCTGAATATAAGCGGCGAGTTGAGATAAACTATTCTCCACAAGAGTTTTGAGTTAGTTCTGCTGAAAAAAATAATTTAGGGCTCTCTCTCTCTACAGACGCAAGGAGGAGTGAGATAGAGCCTGAAACGATGTCGCAGAACGGGAAATTGATGCCCAATCTCGACGAGAAGACCACCAAAGTCCTCAACCTGACGGTGCTGCAGCGGATCGATC...

XM_057951097.1
GTTGAGATAAACTATTCTCCACAAGAGTTTTGAGTTAGTTCTGCTGAAAAAAATAATTTAGGGCTCTCTCTCTCTACAGACGCAAGGAGGAGTGAGATAGAGCCTGAAACGATGTCGCAGAACGGGAAATTGATGCCCAATCTCGACGAGAAGACCACCAAAGTCCTCAACCTGACGGTGCTGCAGCGGATCGATCCATTCGTCGAGGAGATTCTCATCACCGCCGCCCACGTCACCTTCTACGAATTTAACATCGACAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021797
ATGTCGCAGAACGGGAAATTGATGCCCAATCTCGACGAGAAGACCACCAAAGTCCTCAACCTGACGGTGCTGCAGCGGATCGATCCATTCGTCGAGGAGATTCTCATCACCGCCGCCCACGTCACCTTCTACGAATTTAACATCGACACTAGCCAATGGAGTCGGAAGGATGTGGAAGGTTCGCTTTTTGTCGTGAAAAGGAATACCCAGCCAAGGTTCCAGTTTATAGTAATGAACAGACGGAATACTGATAATCTAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807074.1
MSQNGKLMPNLDEKTTKVLNLTVLQRIDPFVEEILITAAHVTFYEFNIDTSQWSRKDVEGSLFVVKRNTQPRFQFIVMNRRNTDNLVENLLGDFEYEVQVPYLLYRNASQEVNGIWFYNARECEEVANLFSRILNAYSKVPTKSKVSSVKSEFEELEAVPTLAVMDGPLEPTSSIANATEVSDDPSFINFFSNAMNIGAAPNTAISGQPFNPSATVIPSSIPQNVSLPTLTTAQPPSNLSASTPIMSILENTERTTTQRS...

XP_057807080.1
MSQNGKLMPNLDEKTTKVLNLTVLQRIDPFVEEILITAAHVTFYEFNIDTSQWSRKDVEGSLFVVKRNTQPRFQFIVMNRRNTDNLVENLLGDFEYEVQVPYLLYRNASQEVNGIWFYNARECEEVANLFSRILNAYSKVPTKSKVSSVKSEFEELEAVPTLAVMDGPLEPTSSIANATENAMNIGAAPNTAISGQPFNPSATVIPSSIPQNVSLPTLTTAQPPSNLSASTPIMSILENTERTTTQRSADLVKPSTFFSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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