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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002693`

染色体: Chr04 坐标: 42338177-42342339 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002693`
名称	SmilChr04G002693
描述	L-ascorbate oxidase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	42338177 - 42342339 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021801`
GeneID	`131021801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021801`
原始查询	`LOC131021801`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase
产物	L-ascorbate oxidase
Arabidopsis	`AT4G39830` (AT4G39830) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830142] identity=65.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0365900` (OsORAP1) - identity=63.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0005576 (extracellular region); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057807075.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057807075.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807075.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807075.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:42338370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B33,B68
`Chr4:42338388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B3,B84,C13,C20
`Chr4:42338475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B28,B59,C57,C81
`Chr4:42338508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:42338574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,A2
`Chr4:42338679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr4:42338684`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr4:42338684`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr4:42338725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B68
`Chr4:42338899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,C18,C27
`Chr4:42338976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:42338990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807075.1

570 aa

285

570

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 36-148 aa PF00394 Cu-oxidase 164-321 aa PF07731 Cu-oxidase_2 433-547 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807075.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	36	148	1.2e-37	129.3	Multicopper oxidase
`XP_057807075.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	164	321	1.1e-43	149.8	Multicopper oxidase
`XP_057807075.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	433	547	5.2e-43	146.8	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951092.1
ATAAAGAAACAGGCGGTACATATATGTGTGTAAAGCAAAAAAATGGAGTTTTTGAAGAAGAAAGTGATAAGATTGTTGATATTAATAGCATGCGTGGTTGGTTGTTGTTCACAAGTGGAGGCGAGAGTTAGGCAGTATAAATGGGAGGTGAAGTACGAGTTGAAGTCTCCCGATTGCTACAAGAAACTGGCAATCACTATCAATGGAAGATCGCCGGGGCCGAGCATCGTGGCTCGAGTAGGAGATACAATCGTTGTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021801
ATGGAGTTTTTGAAGAAGAAAGTGATAAGATTGTTGATATTAATAGCATGCGTGGTTGGTTGTTGTTCACAAGTGGAGGCGAGAGTTAGGCAGTATAAATGGGAGGTGAAGTACGAGTTGAAGTCTCCCGATTGCTACAAGAAACTGGCAATCACTATCAATGGAAGATCGCCGGGGCCGAGCATCGTGGCTCGAGTAGGAGATACAATCGTTGTTCACCTCAAAAACAGTTTGATCACTGAAAATGTTGCAATCCATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807075.1
MEFLKKKVIRLLILIACVVGCCSQVEARVRQYKWEVKYELKSPDCYKKLAITINGRSPGPSIVARVGDTIVVHLKNSLITENVAIHWHGIRQIGTPWMDGTEGVTQCPILPADTFVYKFVVDRPGTYLYHAHYGMQREAGLYGSLRVLLKEGESEPFQYDYDRSIILNDWYHTSVQEQSLGLSSIPFVWVGEPDSILIQGRGKFDCNTPGIAAALCNASNPECAPYAMTVVPGKTYRLRIGSLTALSALSFEIEGHNMTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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