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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001920`

染色体: Chr01 坐标: 34329334-34330618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001920`
名称	SmilChr01G001920
描述	F-box protein At2g27310-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34329334 - 34330618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021823`
GeneID	`131021823`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021823`
原始查询	`LOC131021823`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At2g27310-like
产物	F-box protein At2g27310-like
Arabidopsis	`AT2G27310` (AT2G27310) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817274] identity=36.9; qcov=1.02; evalue=1.53e-71; confidence=medium
Rice	`Os02g0535901` (OsFbox092) - identity=33.4; qcov=0.997; evalue=4.06e-40; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021823

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057807100.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057807100.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807100.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807100.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34329801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:34329823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr1:34329906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B104,C39
`Chr1:34330098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:34330137`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr1:34330137`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr1:34330251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:34330389`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B109
`Chr1:34330389`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B109
`Chr1:34330488`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	84	A13,A24,A3,A7,B110,B112,B118,B120,B122,B123,B126,B128,B13,B135,B136,B14,B140,B20,B21,B22,B23,B24,B29,B32,B33,B36,B38,B4,B41,B42,B43,B47,B52,B54,B6,B63,B66,B7,B71,B73,B77,B82,B85,B88,B89,B9,B93,B95,B98,C10,C11,C12,C13,C19,C32,C35,C43,C47,C48,C5,C51,C54,C56,C58,C59,C6,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C73,C74,C76,C78,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C9,D8
`Chr1:34330489`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:34330489`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807100.1

321 aa

160

321

F-box-like

PF12937 F-box-like 23-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807100.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	23	64	1.4e-05	25.5	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951117.1
TAACATTAATGAAAAACTTGTCGCACGAAATGTTTTGGGGTTTAAATTAATTTCATCGAAGTCAGCATCGATCCTATATAAGCCCCACACTCTTCCACATTCAAAATCAAACCCAATCCACAACCATTGCCGCTCCAAATCAAAACTATATAATCTTTTTATTAAGCTTAAGATTAAGAGTGTGTGAATTAAAAGTAGAGAAAGTTTATGGTTATGTCTAGTTTTGGTTATTCTTCCATTTACTCGGAGTCCGCTCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021823
ATGGTTATGTCTAGTTTTGGTTATTCTTCCATTTACTCGGAGTCCGCTCCCCTCGCCGGCATCCACCCCGATATCATCCAATCCCACATCTTGAGCAGGCTTGACGGCCCCACTCTCGCCACCGCCACCTGCACCTCCGCCGCACTCCTCTCCATGTGCAGCGCCGATCGCCTCTGGAGGGACATCTGCACCTCCACCTGGCCCTCCACCGCCGCCTTCCCCTCCGGACACCGCTCGCTCTACTCCGATGCCTTCCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807100.1
MVMSSFGYSSIYSESAPLAGIHPDIIQSHILSRLDGPTLATATCTSAALLSMCSADRLWRDICTSTWPSTAAFPSGHRSLYSDAFPASRPVPSAAPADTPELISAVDIYYDGAPLYSKVFATEARSAWFLSTPLRLELLGGKETVALPTEPDGGGGEAPCASRAAERLGVSWIVIDPARGRAVNVAGRAAVEAGRDWLSGDIQLRYASVAEDGEMVWCSVAVTCGGKEGGRLRVKEVSMRVEDVEGRLLSGAESLRVLGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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