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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002744`

染色体: Chr04 坐标: 43095427-43098989 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002744`
名称	SmilChr04G002744
描述	phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43095427 - 43098989 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021842`
GeneID	`131021842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021842`
原始查询	`LOC131021842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase 2, chloroplastic-like
产物	phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G39980` (DHS1) 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830159] identity=78.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0389700` (OsDAHPS1) - identity=73; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003849 (3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase activity); GO:0009073 (aromatic amino acid biosynthetic process)
KEGG	smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01474 (DAHP_synth_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807145.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057807145.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807145.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807145.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807145.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43095727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B3,C13,C20
`Chr4:43096687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B33
`Chr4:43098404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:43098445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:43098477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr4:43098582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr4:43098806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807145.1

523 aa

262

523

DAHP_synth_2

PF01474 DAHP_synth_2 72-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807145.1`	Pfam	`PF01474`	DAHP_synth_2	Domain	72	508	4.2e-206	685.3	Class-II DAHP synthetase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951162.1
AAATAAATAAATAAATAAATTTCACCTACCAAACTCCCCCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCTATAAAACCCATTCTGCATTTGCAGCATTTTGTAGAGCCAGCCATCCTCCACAGCTCTCTCATCCTCTCACTCTCACACATTTCCACAGAGACAACAGTTTACAATGGCTGCTTTGCCCAACACCGCTGCCTTCTCCTCCAAATCCGTCATCCAGCCCCAAACCCTCCTCCCAGCCGCCGCCCATTCCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021842
ATGGCTGCTTTGCCCAACACCGCTGCCTTCTCCTCCAAATCCGTCATCCAGCCCCAAACCCTCCTCCCAGCCGCCGCCCATTCCTCCTCATTCTCCTGCGCCCCGGCCTCCAGCGCCGCCCGCCGCCATATCTCTGCCGTGCATGCTGCGGAGCCGGCCAAGGCCCCCGTGGTGACGGCCAAGCCGGCGCCGCCATCCCCCTCCAACGCCAAGTGGACCCCGGAGTCCTGGAAAACGAAGAATGCTCTGCAGCTCCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807145.1
MAALPNTAAFSSKSVIQPQTLLPAAAHSSSFSCAPASSAARRHISAVHAAEPAKAPVVTAKPAPPSPSNAKWTPESWKTKNALQLPEYPDAAELESVLDTMEAYPPLVFAGEVRSLEERLAEAAVGKAFLLQGGDCAESFKEFSANNIRDTFRILLQMSVVLSFGGQLPVIKVGRMAGQFAKPRSDSFEEKDGVKLPSYKGDNINGDAFTEKSRIPDPHRMIRAYCQAASTLNLLRAFATGGYAAMQRVTQWNLDFVENS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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