当前解析结果
SmilChr04G002750| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002750 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002750 |
| 描述 | PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 43178011 - 43179407 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021848 |
|---|---|
| GeneID | 131021848 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021848 |
| 原始查询 | LOC131021848 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like |
| 产物 | PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like |
| Arabidopsis | AT1G29380 (AT1G29380)Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839813] identity=50.3; qcov=0.627; evalue=1.16e-38; confidence=medium |
| Rice | Os01g0631500- identity=73.9; qcov=0.319; evalue=2.61e-39; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07983 (X8) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021848 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057807150.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057807150.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057807150.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057807150.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807150.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057807150.1PF07983
X8 104-173 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057807150.1 |
Pfam | PF07983 |
X8 | Domain | 104 | 173 | 2e-20 | 73.9 | X8 domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。