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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002776`

染色体: Chr04 坐标: 43571199-43574763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002776`
名称	SmilChr04G002776
描述	elongator complex protein 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43571199 - 43574763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021870`
GeneID	`131021870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021870`
原始查询	`LOC131021870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongator complex protein 4
产物	elongator complex protein 4
Arabidopsis	`AT3G11220` (ELO1) Paxneb protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820292] identity=63.8; qcov=0.964; evalue=1.48e-157; confidence=high
Rice	`Os06g0639600` - identity=58.4; qcov=1; evalue=4.03e-148; confidence=high
GO	GO:0002098 (tRNA wobble uridine modification); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008023 (transcription elongation factor complex); GO:0033588 (elongator holoenzyme complex)
KEGG	-
Pfam	PF05625 (PAXNEB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807176.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057807176.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057807176.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057807176.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43574381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,A8,B91,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807176.1

364 aa

182

364

PAXNEB

PF05625 PAXNEB 25-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807176.1`	Pfam	`PF05625`	PAXNEB	Domain	25	364	1.6e-91	307.8	PAXNEB protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951193.1
CCACGGTTAGAATACATAGCTCAGCCCAGTACCATAAGCGTTGGCTCTTGTTCTTCTCAAAAACTCTGAATATGATTTTCATATTTTAACGAATGATTTCAGTTTAACTGTTCGCACACTCTTGTTCTTGTAAGGCTGAAACTAGATTAAAATATCATTGGATGATTTTTGGACTCTCAATTCTTTTTATTCCTTATACGTTTGTGTTTGAGCGCGACCTAACGAGGTTAACCAAACTTCAATTCCAAAGTTGCTTAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021870
ATGGCAATGACTGCTAATAAACCTCGGAGCACCAGTTTCTCACGGAATTTCGGTGCAGCATCAAGTTCTGTTCCCAGCATTCCTGGGCTTAAGCATGGTCCAAACGGGACCATGTTACTTTCATCTGGCATTCCTGACCTCGATAAGATTCTGGGAGGTGGGCTTGCATTGGGAAGTCTAGTGATGGTGATGGAAGATCCGGAGGCGCCGCATCATATGTTATTGTTGAGAAATTTTATGTCTCAGGGCTTGGTTCATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807176.1
MAMTANKPRSTSFSRNFGAASSSVPSIPGLKHGPNGTMLLSSGIPDLDKILGGGLALGSLVMVMEDPEAPHHMLLLRNFMSQGLVHHQPLIYASPASDPRGFLGTLPSPMVSKDEKSRVHETEQEKGLRIAWQYKKYFGEHSSESHRDGKSEYCNDFDLRKPLERHFFSGKQIDCVSLKESADLGAFHERCLSFLSQSNQNNGNITGGRIAIQSLCSPQCEYSNREWEMLSFVRSLKSVVRLSNAVAVVTFSPSLVSTTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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