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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002788`

染色体: Chr04 坐标: 43762037-43765680 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002788`
名称	SmilChr04G002788
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43762037 - 43765680 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021882`
GeneID	`131021882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021882`
原始查询	`LOC131021882`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 2-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 2-like
Arabidopsis	`AT1G66250` (AT1G66250) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842942] identity=73.8; qcov=0.913; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0221500` (OJ1743A09.5) - identity=69.3; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807191.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057807191.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807191.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807191.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43763763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B128,B2,C62,D2
`Chr4:43763780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr4:43763859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B31
`Chr4:43764060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B10,C56
`Chr4:43764108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:43764117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B31,C31
`Chr4:43764369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B2,C62,D2
`Chr4:43764530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:43764792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B2,C62,D2
`Chr4:43764885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:43765347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807191.1

497 aa

248

497

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 26-345 aa PF07983 X8 363-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807191.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	26	345	7.5e-78	263.0	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057807191.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	363	434	2.2e-19	70.5	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951208.1
GAACAGCTGAAAAAATAGTAGGCTTATAACGGCTACCAACAAAGTAAATGTCTTCGCTCGAGGCAGAAACAATGGGACTGTAAAAAGGCCACCTCCAGTAAAAACCAAATAAAAGAGAAGAGAGAGAGAGGAAAGCAATAAAGGAAAACTTAGAACAGGACAGAATGAAGATGATATTTTAGCCGTCGGATCAATCTGACAGGAACTTTTAGTGATTGATGCTCAACCATTTTCCCTCTTCTTAAATACCCTTTCACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021882
ATGGAGAAAATGGCATTAGTGCTTTTACTTTTGGTTTTGACAGTGTCAGCTGTTTCTGCTGATGAAGAACCGTTCATCGGAGTGAACATTGGAACGGAGCTCTCTGATATGCCTCATCCAACTCAAGTTGTTGCACTTCTCAAAGCCCAGCAACTCCGTAATGTCAGGCTGTACGATGCAGACCGTGGCATGCTTCTTGCACTTGCCAATACAGGGATCAGAGTTGCCATCACGGTGCCCAACGAGCAACTTCTGGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807191.1
MEKMALVLLLLVLTVSAVSADEEPFIGVNIGTELSDMPHPTQVVALLKAQQLRNVRLYDADRGMLLALANTGIRVAITVPNEQLLGIGQSNSTAANWVAQNVVAHYPATNITTICVGSEVLTAMPNVAPVLINALKYIQSALVASNLDRQIKVSTPLASSMILDSFPPSQAFFNRTWNPVLVPMLKFLQSTGSYFMLNVYPYFDYMQSNGVIPLDYALFKPLPANKEAVDANTLLHYTNVFDAMVDAAYFAMADLNVTNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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