当前解析结果
SmilChr01G001932| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001932 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001932 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001932 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 34482490 - 34484538 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021897 |
|---|---|
| GeneID | 131021897 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021897 |
| 原始查询 | LOC131021897 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]; symbol=AT5G22280; hit=AT5G22280; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]; symbol=AT5G22280; hit=AT5G22280; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G22280 (AT5G22280)peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288] identity=60.6; qcov=1; evalue=7.55e-33; confidence=medium |
| Rice | Os02g0536100- identity=52.1; qcov=1; evalue=3.38e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021897 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus membrane | 核膜 | 1.00000 | XP_057807207.1 |
| 2 | Nucleus inner membrane | Nucleus inner membrane | 1.00000 | XP_057807207.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057807207.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057807207.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057807207.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:34483273 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,B77,D7 |
Chr1:34484148 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。