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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002872`

染色体: Chr04 坐标: 44845442-44846895 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002872`
名称	SmilChr04G002872
描述	uncharacterized SmilChr04G002872
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44845442 - 44846895 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021960`
GeneID	`131021960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021960`
原始查询	`LOC131021960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825035]; symbol=AT3G58660; hit=AT3G58660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825035]; symbol=AT3G58660; hit=AT3G58660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G58660` (AT3G58660) Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825035] identity=48.8; qcov=0.875; evalue=5.39e-102; confidence=high
Rice	`Os05g0558000` - identity=40.5; qcov=0.714; evalue=3.91e-67; confidence=medium
GO	GO:0030686 (90S preribosome)
KEGG	-
Pfam	PF00687 (Ribosomal_L1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807280.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057807280.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807280.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807280.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44845781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,C2,C46,C66
`Chr4:44845793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C44,C52
`Chr4:44845847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:44846475`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B95
`Chr4:44846475`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B95
`Chr4:44846649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807280.1

384 aa

192

384

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 40-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807280.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	40	245	1.7e-45	155.8	Ribosomal protein L1p/L10e family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951297.1
GAATTTATTTTAGCTCTCCGTCACTTCGCTAAAACCCTACTCTTCCTTCTACCTTAATTCTCCACACCAATGTCTTCCAACGCAGAACACGTCGCCGCCGCCACACCTTCAAGGGTGAGTAAGCCCACCATAGAGGCGGGCGTAAGCGCCCTGTTGAAACACAAAGCCGCCCAATCCGTCAACGAGAAGCCCCAATTACTGCCGCAAGATGATTATTTCTACCTTAACCTCACCCTAAAGAAAATCCCATCAAACCCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021960
ATGTCTTCCAACGCAGAACACGTCGCCGCCGCCACACCTTCAAGGGTGAGTAAGCCCACCATAGAGGCGGGCGTAAGCGCCCTGTTGAAACACAAAGCCGCCCAATCCGTCAACGAGAAGCCCCAATTACTGCCGCAAGATGATTATTTCTACCTTAACCTCACCCTAAAGAAAATCCCATCAAACCCTCGCACGAATCCCTACAGAATCCCACTTCCGAACCCCGTTTTGGACGCCGTCAACTCGGAGGTATGTTTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807280.1
MSSNAEHVAAATPSRVSKPTIEAGVSALLKHKAAQSVNEKPQLLPQDDYFYLNLTLKKIPSNPRTNPYRIPLPNPVLDAVNSEVCLIVDDRPRTTTPPSDEIKKLIKSQNIPISKVIKLSKLRANYKPFEARRKLCNSYDMFLVDKRIVHLLPKLIGKEFFRKKKLPLGMDLRKKNLKLQVERVLGSALLFIGTGTCSVLKVGKVEMEKDEIVDNVLDAIKGVIERVPKKWDGVRSLHLKFSDSVALPIYQAMPDVRLKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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