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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002886`

染色体: Chr04 坐标: 45059347-45062525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002886`
名称	SmilChr04G002886
描述	glutamate decarboxylase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45059347 - 45062525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021971`
GeneID	`131021971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021971`
原始查询	`LOC131021971`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate decarboxylase
产物	glutamate decarboxylase
Arabidopsis	`AT5G17330` (GAD) glutamate decarboxylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831599] identity=84.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0720300` (GDCi) - identity=85.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004351 (glutamate decarboxylase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006538 (L-glutamate catabolic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00430 (Taurine and hypotaurine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00650 (Butanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00282 (Pyridoxal_deC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807287.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057807287.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807287.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057807287.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057807287.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45059580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:45059649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:45059665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C84
`Chr4:45059772`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr4:45059772`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr4:45059774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr4:45059791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C13
`Chr4:45060693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B44,C80
`Chr4:45060795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:45060930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B140
`Chr4:45060940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807287.1

499 aa

250

499

Pyridoxal_deC

PF00282 Pyridoxal_deC 33-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807287.1`	Pfam	`PF00282`	Pyridoxal_deC	Domain	33	381	7.9e-105	351.4	Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951304.1
AAAACCATTCCAATTCTACAAGCAAAAAAGAAACAATACTTTTCTTTCCTTTTCCATCTCTCTTATCAATTTTCTTACCAAGATCTCTCCACCTTGCAAAGCTCCGGCCAGCATGGTTTTGTCGAAGACCGCCTCACAGACTGACGTCTCCGTCCACTCGACGTTCGCGTCCCGATATGTCCGCAACTCCCTCCCAAGGTTTCAAATACCAGAGAACTCGATCCCAAAGGAGGCAGCGTATCAAATCATAAATGATGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021971
ATGGTTTTGTCGAAGACCGCCTCACAGACTGACGTCTCCGTCCACTCGACGTTCGCGTCCCGATATGTCCGCAACTCCCTCCCAAGGTTTCAAATACCAGAGAACTCGATCCCAAAGGAGGCAGCGTATCAAATCATAAATGATGAGCTTATGCTGGATGGGAACCCTAGGTTGAATTTGGCATCATTTGTTACAACATGGATGGAGCCAGAGTGTGACAAGCTTATTATGGCCGCCATTAACAAAAATTATGTTGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807287.1
MVLSKTASQTDVSVHSTFASRYVRNSLPRFQIPENSIPKEAAYQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLIMAAINKNYVDMDEYPVTTELQNRCVNMIAHLFNAPLGDGEAAVGVGTVGSSEAIMLAGLAFKRRWQNKRKQLGKPCDKPNIVTGANVQVCWEKFARYFEVELKEVKLRDGYYVMDPEKAAEMVDENTICVAAILGSTLNGEFEDVKRLNDLLLEKNKQTGWDTPIHVDAASGGFIAPFLYPELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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