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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002890`

染色体: Chr04 坐标: 45111525-45115287 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002890`
名称	SmilChr04G002890
描述	isocitrate dehydrogenase [NADP], chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45111525 - 45115287 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021975`
GeneID	`131021975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021975`
原始查询	`LOC131021975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isocitrate dehydrogenase [NADP], chloroplastic
产物	isocitrate dehydrogenase [NADP]%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G65930` (cICDH) cytosolic NADP+-dependent isocitrate dehydrogenase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842905] identity=86.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0654500` - identity=86.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004450 (isocitrate dehydrogenase (NADP+) activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006102 (isocitrate metabolic process); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00180 (Iso_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807292.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807292.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057807292.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45112107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:45113330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B2,C62,D2
`Chr4:45114335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807292.1

412 aa

206

412

Iso_dh

PF00180 Iso_dh 7-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807292.1`	Pfam	`PF00180`	Iso_dh	Domain	7	402	1.5e-81	275.1	Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951309.1
GACACCTCATCTTTCTAGACTGCAAAAACCCTCACGAGGCCAAAGCCCCACTTCACCTACTCTCCCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCCTTTATATAGTCTGCTCCTCCTTCAACCATTTCTCTTCGTCTGCTCATTTTGGAAGACTAAAACAGATAAACAAAGCAAAAGATAAGCTATGGCGATCCAGAAGATCAAGGTGGCCAACCCCATCGTTGAGATGGACGGTGATGAGATGACAAGGGTCATCTGGCAATTTATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021975
ATGGCGATCCAGAAGATCAAGGTGGCCAACCCCATCGTTGAGATGGACGGTGATGAGATGACAAGGGTCATCTGGCAATTTATCAAAGACAAGTTGATTTTTCCTTTCGTGGAGTTGGATATAAAGTACTTTGACCTTGGCGTTACTCACCGTGATGCCACAGATGATAAAGTTACTGTTGAGAGTGCAGAAGCTACTCTTAAGTACAATGTGGCAATTAAGTGTGCAACGATCACTCCAGATGAAGCTCGTGTTAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807292.1
MAIQKIKVANPIVEMDGDEMTRVIWQFIKDKLIFPFVELDIKYFDLGVTHRDATDDKVTVESAEATLKYNVAIKCATITPDEARVKEFGLKQMWKSPNGTIRNILNGTVFREPILCKNVPRLIPGWTKPICIGRHAFGDQYKATDAVIKGPGKLKMVFVPEGSGETTELEVYNFTGEGGVALSMYNTDESIRSFAEASMNTAYLKKWPLYLSTKNTILKKYDGRFKDIFQEVYESKWRSKFEEAGIWYEHRLIDDMVAYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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