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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000080`

染色体: Chr04 坐标: 722021-725426 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000080`
名称	SmilChr04G000080
描述	vesicle-associated protein 1-3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	722021 - 725426 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022008`
GeneID	`131022008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022008`
原始查询	`LOC131022008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-associated protein 1-3-like
产物	vesicle-associated protein 1-3-like
Arabidopsis	`AT4G00170` (AT4G00170) Plant VAMP (vesicle-associated membrane protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828017] identity=52.1; qcov=1.04; evalue=1.25e-79; confidence=high
Rice	`Os08g0155100` - identity=51.7; qcov=1.03; evalue=5.23e-78; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0061817 (GO:0061817); GO:0090158 (endoplasmic reticulum membrane organization)
KEGG	-
Pfam	PF00635 (Motile_Sperm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057807336.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057807336.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807336.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807336.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:722720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:723066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:723111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:723272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807336.1

227 aa

114

227

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 7-110 aa

XP_057807337.1

227 aa

114

227

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 7-110 aa

XP_057807338.1

227 aa

114

227

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 7-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807336.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	7	110	1.2e-30	106.3	MSP (Major sperm protein) domain
`XP_057807337.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	7	110	1.2e-30	106.3	MSP (Major sperm protein) domain
`XP_057807338.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	7	110	1.2e-30	106.3	MSP (Major sperm protein) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951354.1
AAAAAATAACATTTAAAAAATTAGGTTTGAACAAGTTCCATGGATATTCAACGTCGTACAACAATAAGTGAGAGGAAAATATAAAAACAAAAATAAAAATGAAAAAAGCTATTCCCTTCGTTCTTGATCTTGCAAGGGTTGATATTTGATTTAGGAAAATTCTCGATTTTTTGGAATTCTGCATATCTTCCATTCTCCCCATTTCACAATTCTTAGAAATTTCAGACTGTGTCGCGTAAAATTTCCGGATTAAGATAAAA...

XM_057951355.1
AAAAAATAACATTTAAAAAATTAGGTTTGAACAAGTTCCATGGATATTCAACGTCGTACAACAATAAGTGAGAGGAAAATATAAAAACAAAAATAAAAATGAAAAAAGCTATTCCCTTCGTTCTTGATCTTGCAAGGGTTGATATTTGATTTAGGAAAATTCTCGATTTTTTGGAATTCTGCATATCTTCCATTCTCCCCATTTCACAATTCTTAGAAATTTCAGACTGTGTCGCGTAAAATTTCCGGATTAAGATAAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022008
ATGACAATGGGAGAGCTTCTCCGTATCCAGCCTTCAGAGCTAAAATTTCCATTTGAAGTGAGGAAACAGAGTTCATGTGCTATGCAGTTGGCTAATAAGACAGATCAGTATGTGGCATTTAAGGTTAAGACAACCAATCCAAAAAGGTATTGTGTTCGACCGAATGCTGGCGTTGTTTTGCCCTTTTCTGTGTGCAATATCATAGTTACCATGCAAGCACAGAAGGAGGCTCCCCCTGATATGCAATGTAGGGATAAGTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807336.1
MTMGELLRIQPSELKFPFEVRKQSSCAMQLANKTDQYVAFKVKTTNPKRYCVRPNAGVVLPFSVCNIIVTMQAQKEAPPDMQCRDKFLVQSVIVPNGTTNKDINQEMFNRESEKFVDEFRLRVIFIPANPPSPVPEEDEEGSSPGTSSAEDEIRKSLLSETDRSAVLKLKDEKASVNIQNDKLLGELESMRKQTGQGRHGSIFVLLVGLFIGILVGYFIRIQVPTLL

XP_057807337.1
MTMGELLRIQPSELKFPFEVRKQSSCAMQLANKTDQYVAFKVKTTNPKRYCVRPNAGVVLPFSVCNIIVTMQAQKEAPPDMQCRDKFLVQSVIVPNGTTNKDINQEMFNRESEKFVDEFRLRVIFIPANPPSPVPEEDEEGSSPGTSSAEDEIRKSLLSETDRSAVLKLKDEKASVNIQNDKLLGELESMRKQTGQGRHGSIFVLLVGLFIGILVGYFIRIQVPTLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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