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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000087`

染色体: Chr04 坐标: 778210-783443 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000087`
名称	SmilChr04G000087
描述	phosphatidate cytidylyltransferase 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	778210 - 783443 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022014`
GeneID	`131022014`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022014`
原始查询	`LOC131022014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidate cytidylyltransferase 4, chloroplastic-like
产物	phosphatidate cytidylyltransferase 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G45150` (CDS4) cytidinediphosphate diacylglycerol synthase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819123] identity=78; qcov=0.891; evalue=1.02e-174; confidence=high
Rice	`Os01g0758400` - identity=31.5; qcov=0.522; evalue=5.45e-12; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016772 (transferase activity, transferring phosphorus-containing groups)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01148 (CTP_transf_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022014

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807355.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057807355.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057807358.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057807358.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:779030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C3
`Chr4:779304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:779336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr4:779375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B46,B57,C35,C42
`Chr4:779377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr4:780930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:781764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:781774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B46,B57,C35,C42
`Chr4:781921`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B107,B123,B37,B60,B64,B76,B8,C37,C49,C9
`Chr4:783049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:783069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807355.1

434 aa

217

434

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 142-428 aa

XP_057807356.1

417 aa

208

417

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 125-411 aa

XP_057807357.1

370 aa

185

370

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 142-361 aa

XP_057807358.1

341 aa

170

341

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 49-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807355.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	142	428	5.7e-62	210.7	Cytidylyltransferase family
`XP_057807356.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	125	411	5e-62	210.8	Cytidylyltransferase family
`XP_057807357.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	142	361	2.6e-31	110.1	Cytidylyltransferase family
`XP_057807358.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	49	335	2.6e-62	211.8	Cytidylyltransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951373.1
AATACTAAATTCTTGTATTTAAATTCAAAAAATAAAGTTCGTGGGAAAACTAGAAAATGCTGAAAGTTCGTGTATTTACACGCAAATATTCCGTATTTTAAATCTATTTTTAACATCATTGTTATGCCATCTAACTCGTTGCAATTCCCGAAGTGCAGCTCCACCGAAATCTCCGCCGCTAACAGAAGCGGCGCCGCCGCCCTTCTCAACCTGCGCCTATGCATCCTCTTTCCGTCTGAAACAATTTCCACTTCGCAATG...

XM_057951374.1
TTTAACATCATTGTTATGCCATCTAACTCGTTGCAATTCCCGAAGTGCAGCTCCACCGAAATCTCCGCCGCTAACAGAAGCGGCGCCGCCGCCCTTCTCAACCTGCGCCTATGCATCCTCTTTCCGTCTGAAACAATTTCCACTTCGCAATGGCTTCGCAAGTTGTAGAATTGGATAGAATTGCTTTAATTCCGCTCTCCGTCAGCTCCCTCTGCTCCGGCCGTTCTCACTCCCACTTTCGTCACCGGCCAACCCTTCCG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131022014
ATGGCTTCGCAAGTTGTAGAATTGGATAGAATTGCTTTAATTCCGCTCTCCGTCAGCTCCCTCTGCTCCGGCCGTTCTCACTCCCACTTTCGTCACCGGCCAACCCTTCCGAGATTTGCCGCACAATCGAATTATCAGAAAATTAGGTTCAAGTTAGATGTAAATGGCAGTGGCGTGCAAGGGCTTTCTAGAACTCCTAGGGGGGTTTTATCCAATCGACGCCGGCGGGTGATACTGGGAGTGGCTAGCGCAGAGCAGCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057807355.1
MASQVVELDRIALIPLSVSSLCSGRSHSHFRHRPTLPRFAAQSNYQKIRFKLDVNGSGVQGLSRTPRGVLSNRRRRVILGVASAEQPERIDGGELSDELVHHLEGTQESKSFQNLRVQRGNQSSGESDLDEEHRKKTSQLRKRIIFGLGIGVLVGGVVLAGEWVFTVALSAAVFAGSREYFELVRSRGIASGMTPPPRYVSRACSVICCVMPLLTLYFGHIDVSVTSAAFFVATALLLQRGNPRFSQLSTTMFGLFYCGY...

XP_057807356.1
MASQVVELDRIALIPLSVSSLCSGRSHSHFRHRPTLPRFAAQSNYQKIRFKLDVNGSGVQGLSRTPRGVLSNRRRRVILGVASAEQPERIDGGELSDEEVQRGNQSSGESDLDEEHRKKTSQLRKRIIFGLGIGVLVGGVVLAGEWVFTVALSAAVFAGSREYFELVRSRGIASGMTPPPRYVSRACSVICCVMPLLTLYFGHIDVSVTSAAFFVATALLLQRGNPRFSQLSTTMFGLFYCGYLPCFWVKLRCGLAAPAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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