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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000091`

染色体: Chr04 坐标: 816821-818828 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000091`
名称	SmilChr04G000091
描述	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	816821 - 818828 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022018`
GeneID	`131022018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022018`
原始查询	`LOC131022018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1
产物	protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1
Arabidopsis	`AT3G60670` (AT3G60670) PLATZ transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825238] identity=47.6; qcov=0.905; evalue=9.13e-48; confidence=medium
Rice	`Os02g0183000` - identity=44.4; qcov=0.886; evalue=3.48e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04640 (PLATZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807363.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807362.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807362.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807362.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807362.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:817174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:817189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:817252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B67,C37,C49
`Chr4:817255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C31
`Chr4:817342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:817581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B140,B5
`Chr4:817933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C26,C41
`Chr4:817982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A3,B100,B121,B126,B134,B84,B87,B89,C15,C17,C50,C58,C65,C74,C9,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807362.1

237 aa

118

237

PLATZ

PF04640 PLATZ 59-130 aa

XP_057807363.1

211 aa

106

211

PLATZ

PF04640 PLATZ 33-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807362.1`	Pfam	`PF04640`	PLATZ	Family	59	130	1.5e-26	93.5	PLATZ transcription factor
`XP_057807363.1`	Pfam	`PF04640`	PLATZ	Family	33	104	8e-27	94.4	PLATZ transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951379.1
TGCCAAAAAGATGATACCAACATTTCTCAGTGGACAGAAAATGGTCTCTTTTTTCTCTGATGAATCCAATATATTTTCTCCGATAACTGAGAAAAGTCACCATCTTCGTCTTGTCATTTAGCTCACCCCATCACCTCTTCTCTCTCTACACACAGATATCATAATCTCTTCTAGCTCTCTAGCTCTCCCTTTTCACCTCTGTCATTTCATAGGCTTACATCAATCTATCGACAAATCTAGGGTTACACAGATTGAGGAAG...

XM_057951380.1
TTGGAGGTTCCGGAATGGCTGCTGGCGCTCTTATCGGAGAAGTTCTTCAATTGCTGCGTGATTCACCTCGATGCGAAGAAGAATGAGAAAAACGTATTTTGCTTGGATTGCTGCTCCGGAATCTGCCCTCATTGTGTGCCGGAGCATCGCTCCCACCGCCTCTTGCAGAAGGTATGTGTATCACGATGTGATAAGGATCGCCGACGCCGATAAACTCATCGATTGCGCTCAGATTCAAACATACACCACTAACAGCGCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022018
ATGTTGGAGGTTCCGGAATGGCTGCTGGCGCTCTTATCGGAGAAGTTCTTCAATTGCTGCGTGATTCACCTCGATGCGAAGAAGAATGAGAAAAACGTATTTTGCTTGGATTGCTGCTCCGGAATCTGCCCTCATTGTGTGCCGGAGCATCGCTCCCACCGCCTCTTGCAGATCAGAAGGTATGTGTATCACGATGTGATAAGGATCGCCGACGCCGATAAACTCATCGATTGCGCTCAGATTCAAACATACACCACTAA...

LOC131022018
ATGCGAAGAAGAATGAGAAAAACGTATTTTGCTTGGATTGCTGCTCCGGAATCTGCCCTCATTGTGTGCCGGAGCATCGCTCCCACCGCCTCTTGCAGAAGGTATGTGTATCACGATGTGATAAGGATCGCCGACGCCGATAAACTCATCGATTGCGCTCAGATTCAAACATACACCACTAACAGCGCGAAAGTAGTTTTCCTGAATCAGCGGCCGCTGACGCGGCCGCCGAGAGCTTCCGGCAACGTCTGCGTCGGCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807362.1
MLEVPEWLLALLSEKFFNCCVIHLDAKKNEKNVFCLDCCSGICPHCVPEHRSHRLLQIRRYVYHDVIRIADADKLIDCAQIQTYTTNSAKVVFLNQRPLTRPPRASGNVCVGCDRNLQELSLFCSISCKLDHILETGGELSSHIRNCEFLVLPDGADDGQMTADSVLEPSGSTRTDSGSSSGGLGECPYLISTATTEVVRKKRSGPAGFRPGCRPASEISESIMNRRKGTPQRSPLH

XP_057807363.1
MRRRMRKTYFAWIAAPESALIVCRSIAPTASCRRYVYHDVIRIADADKLIDCAQIQTYTTNSAKVVFLNQRPLTRPPRASGNVCVGCDRNLQELSLFCSISCKLDHILETGGELSSHIRNCEFLVLPDGADDGQMTADSVLEPSGSTRTDSGSSSGGLGECPYLISTATTEVVRKKRSGPAGFRPGCRPASEISESIMNRRKGTPQRSPLH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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