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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000117`

染色体: Chr04 坐标: 1014676-1019796 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000117`
名称	SmilChr04G000117
描述	uncharacterized SmilChr04G000117
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1014676 - 1019796 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022047`
GeneID	`131022047`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022047`
原始查询	`LOC131022047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828179]; symbol=AT4G00090; hit=AT4G00090; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828179]; symbol=AT4G00090; hit=AT4G00090; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G00090` (AT4G00090) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828179] identity=70.3; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0858400` (OsWD40-97) - identity=63.5; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022047

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807401.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057807401.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057807401.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807401.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1014988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B90,B92,C87
`Chr4:1015551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:1015680`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr4:1015680`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr4:1015923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B122,B62
`Chr4:1015960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:1015962`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C2
`Chr4:1016721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr4:1016773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:1018590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B90,B92,C87
`Chr4:1018592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:1018642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B70,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807401.1

439 aa

220

439

WD40

PF00400 WD40 83-117 aa PF00400 WD40 293-326 aa PF00400 WD40 393-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807401.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	83	117	1.7e-31	108.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057807401.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	293	326	1.7e-31	108.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057807401.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	393	431	1.7e-31	108.0	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951418.1
TTTGATAATGTGGCACCTACGACTTTGGGTTTAAGAAATGCTCTAAAGAAATCGCGGCTGCTCGCAAACGCGACACTAACTGAAATTGGAAATTTCAGATCGCAGGCGACTTTTCCGCCGTGGCAATTCTTGAACAAGATTTGCAGAAGCTTCTGCGTCGCAGCAAATCCCCTAAATTGGAAGGATAGCCGACAAATTCTAAGAAATGGACGCAGTTCTCTCGATTTTCGCATTCTCAGGGATCGTCGGCGCCGTGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022047
ATGGACGCAGTTCTCTCGATTTTCGCATTCTCAGGGATCGTCGGCGCCGTGATCGCGTTCGTGGTATTCAGTGCTTATTCCCGGAAGAGAAAATCGGAAATTCAGTCCATCACCCGACCCGAGAACCTCAACCCGAACCCGAAGCCCGCTTCGAAGCCCTCGGCTGCCAAGAAGCCTCAGCACAAATCTCATTCCCATTCTCATGCAGCCGATAAAGATGCTAATAAGAAGCATCATCACTTGGATTTGAATACTTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807401.1
MDAVLSIFAFSGIVGAVIAFVVFSAYSRKRKSEIQSITRPENLNPNPKPASKPSAAKKPQHKSHSHSHAADKDANKKHHHLDLNTLKGHGDAVTGLSFSPDGRSLATACGDGVVRIFRLDDASSKSFKFLRINLPAGGHPKAVSFAGDASSIVVASQALSGSSLYMYEEEKPKTIGDQKQQSKLPLPEIKWEHHKVHDKRAIITLVGAKATYGSADGSTIILSCSEGTDIILWHGKTGKSLGNVDTNQLKNTMATISPNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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