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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000118`

染色体: Chr04 坐标: 1020791-1025315 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000118`
名称	SmilChr04G000118
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP53-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1020791 - 1025315 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022048`
GeneID	`131022048`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022048`
原始查询	`LOC131022048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP53-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP53-like
Arabidopsis	`AT3G12340` (AT3G12340) FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820412] identity=41.2; qcov=0.359; evalue=1.86e-37; confidence=low
Rice	`Os09g0293900` (OsFKBP53) - identity=53.4; qcov=0.22; evalue=1.67e-36; confidence=weak
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C); PF17800 (NPL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022048

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807402.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057807402.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807402.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807402.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807402.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1021225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:1021632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C84
`Chr4:1022025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:1022106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:1022149`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr4:1022149`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr4:1022514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D10
`Chr4:1023010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:1023484`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr4:1023484`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr4:1023547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:1024261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807402.1

663 aa

332

663

NPL

FKBP_C

PF17800 NPL 3-95 aa PF00254 FKBP_C 571-659 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807402.1`	Pfam	`PF17800`	NPL	Domain	3	95	2.4e-21	77.0	Nucleoplasmin-like domain
`XP_057807402.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	571	659	9.4e-26	90.7	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951419.1
AATGGATACGGTGTGATTTCACCCATTTTTATTGTGACTATTTCCTTTTCTTCCCTCTTGAAAAGTAGTAGTAAATGTTATATTTTCTCTTAAATTATGAATAAATAGCGATTTATCGTCGGAAAAGAAAGGTCGCCGCAAAAAGGAGAATCTATTCTCCCGCCATACCTCTCACTATATAGCCTCTGATCTCATCAGTTATCAATCTCACGCTGGGGTTTAAAAGGGGAAGAAATCAAAACACTGATTTGATTTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022048
ATGGCTTTCTGGGGCGTGGAGGTGCGGCCTGGGCAGCCGATAACGCATTCCTGTGAGAAGGCAAGAGGAAGACTTCGGATTTCGCAGGCGACATTGGGATTTGGCGAGTCTTTAAAGAGCTCTGTCGTACAGTGTAATGTGGGTAATAAAAGCCCGGTTCTGCTCTGCGTGCTGCTACCAGGCCGAGTGGAGTCATCCCATGTAGAATTGGAATTTGAGGAGGCGGATGATGTGATTTTTTCTGTTGTTGGTCCACGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807402.1
MAFWGVEVRPGQPITHSCEKARGRLRISQATLGFGESLKSSVVQCNVGNKSPVLLCVLLPGRVESSHVELEFEEADDVIFSVVGPRSVYLSGYYIRQNGRSNSRSDTESYGVDIEHSPTDRSNYNSDDDDGYEDSFINDDELQVSSPGSHIFYSKGMDEVMPEKNKSKSKKGRSKLRRKKQWMIESDNDVSSPQKEDEAGEMDDESKRDAKCDVGESDDEAKDDDIYGSETKQEVDPLDISDKTERVTQQPSLDEEGIEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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