当前解析结果
SmilChr04G000135| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000135 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000135 |
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP18-1 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1156920 - 1159675 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022065 |
|---|---|
| GeneID | 131022065 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022065 |
| 原始查询 | LOC131022065 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP18-1 |
| 产物 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP18-1 |
| Arabidopsis | AT1G01940 (AT1G01940)Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839309] identity=91.2; qcov=1; evalue=4.04e-109; confidence=high |
| Rice | Os06g0130500 (OsCYP18-1)- identity=87.4; qcov=0.994; evalue=1.77e-105; confidence=high |
| GO | GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0006457 (protein folding); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00160 (Pro_isomerase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022065 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057807427.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057807427.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057807427.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057807427.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807427.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057807427.1PF00160
Pro_isomerase 3-152 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057807427.1 |
Pfam | PF00160 |
Pro_isomerase | Domain | 3 | 152 | 3.1e-53 | 181.0 | Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。