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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000140`

染色体: Chr04 坐标: 1195977-1204618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000140`
名称	SmilChr04G000140
描述	putative transferase At1g60990, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1195977 - 1204618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022071`
GeneID	`131022071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022071`
原始查询	`LOC131022071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative transferase At1g60990, chloroplastic
产物	putative transferase At1g60990%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G60990` (AT1G60990) Glycine cleavage T-protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842391] identity=67.1; qcov=0.894; evalue=5.49e-155; confidence=high
Rice	`Os04g0623800` (Amt) - identity=23.4; qcov=0.806; evalue=8.11e-07; confidence=weak
GO	GO:0004047 (aminomethyltransferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0019464 (glycine decarboxylation via glycine cleavage system)
KEGG	-
Pfam	PF01571 (GCV_T); PF08669 (GCV_T_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807434.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057807434.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807434.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807434.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807434.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1196162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr4:1196196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B35,B53,B75
`Chr4:1197049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B36,B48,B98,C59
`Chr4:1197052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:1199473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:1199625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:1200596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:1200605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:1202440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:1202455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:1202506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:1202513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807434.1

408 aa

204

408

GCV_T

GCV_T_C

PF01571 GCV_T 79-307 aa PF08669 GCV_T_C 328-386 aa

XP_057807435.1

360 aa

180

360

GCV_T

PF01571 GCV_T 79-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807434.1`	Pfam	`PF01571`	GCV_T	Domain	79	307	2e-22	80.2	GCVT N-terminal domain
`XP_057807434.1`	Pfam	`PF08669`	GCV_T_C	Domain	328	386	5.4e-06	26.9	Glycine cleavage T-protein C-terminal barrel domain
`XP_057807435.1`	Pfam	`PF01571`	GCV_T	Domain	79	307	1.4e-22	80.7	GCVT N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951451.1
GAAGCCTATTTAAATTGTCATTTTGTTAAAAATAACGATTTGTAATTTGAGTTAATTTAACAAAGGTCTGCAAATTTAATTGGACACACAAAATTCAAATTCTGATCAAACTCCGTTGGTCGGAAGCAGACGGATATGTTATCCCACTTCACTTCCATTTCATGCTTCTGCTCGGTGCGGCAATCCTTCCACGCGCCGCCGTCTCACCATCCCCAAACCCATGCGTTTTGCTGTCGTCAGAAGAAGAGCAAGGAGCGGTT...

XM_057951452.1
AATAACGATTTGTAATTTGAGTTAATTTAACAAAGGTCTGCAAATTTAATTGGACACACAAAATTCAAATTCTGATCAAACTCCGTTGGTCGGAAGCAGACGGATATGTTATCCCACTTCACTTCCATTTCATGCTTCTGCTCGGTGCGGCAATCCTTCCACGCGCCGCCGTCTCACCATCCCCAAACCCATGCGTTTTGCTGTCGTCAGAAGAAGAGCAAGGAGCGGTTCTCGCTGTCACCGGCGGCGCTCCCTTTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022071
ATGTTATCCCACTTCACTTCCATTTCATGCTTCTGCTCGGTGCGGCAATCCTTCCACGCGCCGCCGTCTCACCATCCCCAAACCCATGCGTTTTGCTGTCGTCAGAAGAAGAGCAAGGAGCGGTTCTCGCTGTCACCGGCGGCGCTCCCTTTCGACCTCTCCCCTCCTCCCATCGACCTCGACCCGCTGGAGACAGTGACTTTTCCTGAAGAAGATGGAACAACAGATACATACGCCAGTGCAGATGAGGCACTGGATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807434.1
MLSHFTSISCFCSVRQSFHAPPSHHPQTHAFCCRQKKSKERFSLSPAALPFDLSPPPIDLDPLETVTFPEEDGTTDTYASADEALDAFVNGAVVVDLSEYGRIRVSGEDRIQFLHNQTTANFECLGEGQGCDTVFVTPTARTIDISHAWVMNNAVILVVSPVTCGSITEMLKKYIFFSDKVEIQDITKQTSMCALLGPKSSKIMDALNLGDLTGKAYGSHKHYSVDGMAVTVAVGSTISVEGFTFMMSPAAAGSVRKALT...

XP_057807435.1
MLSHFTSISCFCSVRQSFHAPPSHHPQTHAFCCRQKKSKERFSLSPAALPFDLSPPPIDLDPLETVTFPEEDGTTDTYASADEALDAFVNGAVVVDLSEYGRIRVSGEDRIQFLHNQTTANFECLGEGQGCDTVFVTPTARTIDISHAWVMNNAVILVVSPVTCGSITEMLKKYIFFSDKVEIQDITKQTSMCALLGPKSSKIMDALNLGDLTGKAYGSHKHYSVDGMAVTVAVGSTISVEGFTFMMSPAAAGSVRKALT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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