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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000142`

染色体: Chr04 坐标: 1210995-1212027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000142`
名称	SmilChr04G000142
描述	60S acidic ribosomal protein P3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1210995 - 1212027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022072`
GeneID	`131022072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022072`
原始查询	`LOC131022072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S acidic ribosomal protein P3-like
产物	60S acidic ribosomal protein P3-like
Arabidopsis	`AT4G25890` (AT4G25890) 60S acidic ribosomal protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828695] identity=71; qcov=0.566; evalue=4.6e-26; confidence=medium
Rice	`Os01g0231700` - identity=64.5; qcov=0.992; evalue=5.34e-23; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00428 (Ribosomal_60s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807437.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807437.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807437.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807437.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1211245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr4:1211258`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	101	A1,A10,A14,A15,A18,A20,A25,A3,A5,A8,B10,B102,B103,B104,B105,B107,B109,B112,B115,B118,B119,B122,B126,B13,B130,B131,B132,B137,B16,B17,B18,B23,B24,B26,B3,B31,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B5,B50,B55,B56,B59,B62,B69,B7,B70,B84,B85,B86,B88,B96,B98,B99,C12,C13,C17,C18,C21,C25,C26,C27,C29,C3,C34,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C46,C53,C60,C63,C64,C66,C76,C79,C80,C82,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D8
`Chr4:1211264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C33,C4,C62
`Chr4:1211768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:1211906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:1211907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807437.1

122 aa

122

Ribosomal_60s

PF00428 Ribosomal_60s 40-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807437.1`	Pfam	`PF00428`	Ribosomal_60s	Family	40	119	1.7e-13	51.6	60s Acidic ribosomal protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951454.1
CGCCCGCACCCTTAAAATTCCTCACAGCAAAAAGCCTTCATCCATTCGTCTCAACTAATTCAACACCAGACCTTGAGATCGTAAGGAAAATGGGCGTTTTCACGTTTGTGTGCAGAGAATCCGGTTCCGATTGGACGGCAAAGCAGCTCAACGGCGAGCTGGAGGCTTCCGCCGACTCCACCTTCGGCCTCCAGCGTAAGCTCGTTCAGGCCGCTCTCTCCTCCGACTCCGGCGCCGTCCAGTCCTCCTTCTCCTACGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022072
ATGGGCGTTTTCACGTTTGTGTGCAGAGAATCCGGTTCCGATTGGACGGCAAAGCAGCTCAACGGCGAGCTGGAGGCTTCCGCCGACTCCACCTTCGGCCTCCAGCGTAAGCTCGTTCAGGCCGCTCTCTCCTCCGACTCCGGCGCCGTCCAGTCCTCCTTCTCCTACGTCACTCCTAAATCCGCCGTATTTCAGGTGATTGTTGGAGGTGGAGGTGGTGGTTCCTTTGTGGGAGGTGGAGGTGCTGCAGCTGCAGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807437.1
MGVFTFVCRESGSDWTAKQLNGELEASADSTFGLQRKLVQAALSSDSGAVQSSFSYVTPKSAVFQVIVGGGGGGSFVGGGGAAAAASGGGGGAAAEAPAAEKKEEEKEESDDDIGMSLFDDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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