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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000143`

染色体: Chr04 坐标: 1239143-1242531 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000143`
名称	SmilChr04G000143
描述	cation transporter HKT1;5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1239143 - 1242531 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022073`
GeneID	`131022073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022073`
原始查询	`LOC131022073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cation transporter HKT1;5-like
产物	cation transporter HKT1%3B5-like
Arabidopsis	`AT4G10310` (HKT1) high-affinity K+ transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826623] identity=48.8; qcov=0.949; evalue=5.38e-142; confidence=high
Rice	`Os02g0175000` (HKT1;3) probable cation transporter HKT6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4328468] identity=44.2; qcov=1.06; evalue=2.56e-133; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0008324 (monoatomic cation transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02386 (TrkH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057807438.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057807438.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057807438.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807438.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807438.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1239501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:1239610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:1239642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:1239679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B48
`Chr4:1239685`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B48
`Chr4:1239685`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B48
`Chr4:1239787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr4:1239825`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C69
`Chr4:1239825`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C69
`Chr4:1239846`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B83,C13,C20,C4,C59,D7
`Chr4:1239958`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B74,C39
`Chr4:1239958`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B74,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807438.1

488 aa

244

488

TrkH

PF02386 TrkH 65-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807438.1`	Pfam	`PF02386`	TrkH	Family	65	475	1.2e-32	113.8	Cation transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951455.1
ACTAAACATAATTGTTAATTAAGGTCGATTATATTGAAATAACATGATTAAGGTTGACCGTATTAAACTAAACATAATTGTTAATTACTCCTACTATATATACCCTCACTGCGTCTGCACATCGTCTCCTCCACGAGCAAAAACAACCCCACAAAACTCAGCTCGATCGCGTGCGTGAAAATGGAGCACTTCTATGGCTACATAGACAAAATGCAAAGCCTTTACAGTAGCTCATGGAAGCTAACCAGCCTCGCTTACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022073
ATGGAGCACTTCTATGGCTACATAGACAAAATGCAAAGCCTTTACAGTAGCTCATGGAAGCTAACCAGCCTCGCTTACCGCCTTCTCATCTCCAAATGCAACGCCTTCTTCACATCTATTCTCTACTTCCTCTCCATCTCCTCACTCGGCTTCGTGATGCTCAAATCATGCAATCCCCGAACGACGTCGTACGCGCCCAGCAACATCGACTTGCTCTTCACATCCGTGTCGGCGGCCACCGCGTCGAGCATGATGACGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807438.1
MEHFYGYIDKMQSLYSSSWKLTSLAYRLLISKCNAFFTSILYFLSISSLGFVMLKSCNPRTTSYAPSNIDLLFTSVSAATASSMMTVEMEVFSQQQLIVMTALMLLGGEIFTSICFTAKPSSDHQIHDLSRSLTLRNDSIKYLGILVLGYVAVIQILGVASLLTYLSLVSSAGSVLRRKGIKPSIFAVFTIVSTFANCGFIPTNENLIVFSGNTGLLLILIPQILLGNTLFPLALRGVIWGLGKRFKRNEAEYLLRNSRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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