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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000185`

染色体: Chr04 坐标: 1635759-1641069 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000185`
名称	SmilChr04G000185
描述	bystin-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1635759 - 1641069 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022111`
GeneID	`131022111`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022111`
原始查询	`LOC131022111`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bystin-like
产物	bystin-like
Arabidopsis	`AT1G31660` (AT1G31660) bystin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840053] identity=60.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0352400` - identity=59.4; qcov=0.978; evalue=1.03e-173; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0030688 (preribosome, small subunit precursor)
KEGG	-
Pfam	PF05291 (Bystin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022111

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807493.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057807495.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057807493.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807495.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1636409`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr4:1636409`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr4:1636873`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	B105,B109,B11,B111,B121,B129,B30,B64,B76,B95,C29,C57,C64,C66,C71,C84
`Chr4:1636896`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C55
`Chr4:1636896`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C55
`Chr4:1636960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C38,C76
`Chr4:1638898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B106,B20,C16,C21
`Chr4:1639580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B55,C9
`Chr4:1639602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C38,C76
`Chr4:1639646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B77,B8,C16
`Chr4:1640177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B61,C47
`Chr4:1640187`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A6,B105,B135,B56,B63,B83,B96,C19,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807493.1

465 aa

232

465

Bystin

PF05291 Bystin 138-420 aa

XP_057807495.1

453 aa

226

453

Bystin

PF05291 Bystin 138-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807493.1`	Pfam	`PF05291`	Bystin	Repeat	138	420	5.4e-130	433.6	Bystin
`XP_057807495.1`	Pfam	`PF05291`	Bystin	Repeat	138	420	5.1e-130	433.7	Bystin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951512.1
TCTGTGTGCAATAACGATTAACGCAACATTCCACAATAACAAATAATCTCTCTCTCTCTCTTCGCGCCGTGACACCCAGCCGCCGGAGCCCACCCACTGACACCCAGTCCCGCCGTTCGCCGGTAGTCCCGCCGGCTCCGCGAGCCAACCTCCCAGCAGACCGTTCGAGAGAGGCGACTAGGCGAGAGCAGAGAGCCTGAGACTCCAGCTCTGAGCCTCGCCGCTCAACGCCGGTAGTCACGCCGCCGCAGCTCTGAACC...

XM_057951510.1
TCTGTGTGCAATAACGATTAACGCAACATTCCACAATAACAAATAATCTCTCTCTCTCTCTTCGCGCCGTGACACCCAGCCGCCGGAGCCCACCCACTGACACCCAGTCCCGCCGTTCGCCGGTAGTCCCGCCGGCTCCGCGAGCCAACCTCCCAGCAGACCGTTCGAGAGAGGCGACTAGGCGAGAGCAGAGAGCCTGAGACTCCAGCTCTGAGCCTCGCCGCTCAACGCCGGTAGTCACGCCGCCGCAGCTCTGAACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022111
ATGTCAAAGAAACGTTCGCGAATCACGAATCCGGAGCCGTTCTTGCCGTTGGGCTCCGACGCATTCTCCACCGGCAAGAAGCGGAGCAAGCCGCCGAAGCACCACCAGCTAGAGGACAAGCTCGTCCCGTCGACCGTCAGTTCTAAGATTCTCAAGGAAGCCCTTTTACAGCAGAAGGAGATCCGGCGAGAAGAGGAAAACGACAACAATGTCGCTGACCACAACCCTAGCACTAAAATTGTGTTTCCTCAAATTCACGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807493.1
MSKKRSRITNPEPFLPLGSDAFSTGKKRSKPPKHHQLEDKLVPSTVSSKILKEALLQQKEIRREEENDNNVADHNPSTKIVFPQIHGLKDNENDDDDVDDFEGFSETQSQFGQWNFEDDINEEEEKLLDAFLSKDDRPERTLADIIVEKIKEKDAQVSSGAQPMPKLDNSIIELYKGVGKLLNKYTSGKMPKAFKHVPSLQFWEEVLYLTEPDKWSPNAMYQATRIFASNMGVKKVERFYKFVLLPRVREDIQKNKRLHF...

XP_057807495.1
MSKKRSRITNPEPFLPLGSDAFSTGKKRSKPPKHHQLEDKLVPSTVSSKILKEALLQQKEIRREEENDNNVADHNPSTKIVFPQIHGLKDNENDDDDVDDFEGFSETQSQFGQWNFEDDINEEEEKLLDAFLSKDDRPERTLADIIVEKIKEKDAQVSSGAQPMPKLDNSIIELYKGVGKLLNKYTSGKMPKAFKHVPSLQFWEEVLYLTEPDKWSPNAMYQATRIFASNMGVKKVERFYKFVLLPRVREDIQKNKRLHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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