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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000196`

染色体: Chr04 坐标: 1742191-1744383 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000196`
名称	SmilChr04G000196
描述	ATP synthase subunit delta', mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1742191 - 1744383 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022125`
GeneID	`131022125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022125`
原始查询	`LOC131022125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase subunit delta', mitochondrial-like
产物	ATP synthase subunit delta'%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G47030` (AT5G47030) ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834749] identity=54.4; qcov=0.876; evalue=1.16e-66; confidence=high
Rice	`Os07g0495200` (RMtATPd1) - identity=55.8; qcov=0.938; evalue=5.9e-72; confidence=high
GO	GO:0000275 (GO:0000275); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02823 (ATP-synt_DE_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807518.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057807518.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.40000	`XP_057807518.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057807518.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1742384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:1742385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C45
`Chr4:1742415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B103
`Chr4:1742524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B90,C87,D11
`Chr4:1742577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:1742632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C37,C75,C87
`Chr4:1742634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:1742650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B90,B92,C87
`Chr4:1742705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B64,C70
`Chr4:1744254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:1744261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B97,C35,D11
`Chr4:1744294`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A22,A8,B10,B102,B118,B40,B49,B56,B65,B7,B80,B82,B96,C27,C7,C77,D1,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807518.1

193 aa

193

ATP-synt_DE_N

PF02823 ATP-synt_DE_N 75-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807518.1`	Pfam	`PF02823`	ATP-synt_DE_N	Domain	75	144	2.5e-17	63.3	ATP synthase, Delta/Epsilon chain, beta-sandwich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951535.1
AAACACAATTAAAGTTTTCGAGCGATTAAACGCTAGTTTCAAGTAAATGATTATGCGTTGCACTAGACATATCTCGGCCATTCAGCCATGTTCCGCCGTGGCGCCGCCCGCCTACTTCTGCACCGCCGCCGCCTCTCCACTACCGATGTTCGAACGGTGCCGGCAGCGGATGACCTATTCGCGGCGGCTTGGAGAAGAATAGCGCCTAACGTCGACTTGCCCGAGACTCCACTGGCCTTCCGGCAACCGTCCACCACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022125
ATGTTCCGCCGTGGCGCCGCCCGCCTACTTCTGCACCGCCGCCGCCTCTCCACTACCGATGTTCGAACGGTGCCGGCAGCGGATGACCTATTCGCGGCGGCTTGGAGAAGAATAGCGCCTAACGTCGACTTGCCCGAGACTCCACTGGCCTTCCGGCAACCGTCCACCACTTCCGCAGCCTCAAAGCTGACCATCAACTTCAATTCGCGCTACTCCTCGCGCTTCTCCAATAAACAGGTGGACATGGTGGTAGCACCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807518.1
MFRRGAARLLLHRRRLSTTDVRTVPAADDLFAAAWRRIAPNVDLPETPLAFRQPSTTSAASKLTINFNSRYSSRFSNKQVDMVVAPGVAGQIGILPGHVASISELKPGLLSIHEDGEVMKYFISSGFAFVHSNSVIEIFAVEAVTIKQIDPASVQKGLAEFTQKLSMASTDAEKAEAQIALDVLTSLDSSLAG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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