当前解析结果
SmilChr04G000205| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000205 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000205 |
| 描述 | vesicle transport protein GOT1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 1822967 - 1825650 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022134 |
|---|---|
| GeneID | 131022134 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022134 |
| 原始查询 | LOC131022134 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | vesicle transport protein GOT1-like |
| 产物 | vesicle transport protein GOT1-like |
| Arabidopsis | AT3G49420 (AT3G49420)Got1/Sft2-like vescicle transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824104] identity=47.9; qcov=1.01; evalue=2.56e-40; confidence=medium |
| Rice | Os03g0209400 (GOT1B)- identity=47.9; qcov=1.01; evalue=1.99e-39; confidence=medium |
| GO | GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022134 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.80000 | XP_057807527.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057807527.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057807527.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057807527.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807527.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:1823510 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B44,B47 |
Chr4:1823639 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,B57 |
Chr4:1823683 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,C26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。