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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000231`

染色体: Chr04 坐标: 2053655-2058843 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000231`
名称	SmilChr04G000231
描述	serine/threonine-protein kinase BSK2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2053655 - 2058843 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022155`
GeneID	`131022155`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022155`
原始查询	`LOC131022155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase BSK2
产物	serine/threonine-protein kinase BSK2
Arabidopsis	`AT5G46570` (BSK2) BR-signaling kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834700] identity=81.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0571300` (OsRLCK308) - identity=86; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF25575 (TPR_BSK1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022155

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807556.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057807557.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807556.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807556.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2053985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:2054329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,C2,C36,C63,C80
`Chr4:2054605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:2054606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:2054933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:2055097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:2057706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B140,D4
`Chr4:2057712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807556.1

493 aa

246

493

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

TPR_BSK1_C

PF00069 Pkinase 72-305 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 72-307 aa PF25575 TPR_BSK1_C 344-461 aa

XP_057807557.1

487 aa

244

487

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

TPR_BSK1_C

PF00069 Pkinase 66-299 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 66-301 aa PF25575 TPR_BSK1_C 338-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807556.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	72	305	7e-27	95.2	Protein kinase domain
`XP_057807556.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	72	307	1.7e-29	103.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057807556.1`	Pfam	`PF25575`	TPR_BSK1_C	Repeat	344	461	1.2e-53	180.7	Serine/threonine-protein kinase BSK1-like, TPR repeats
`XP_057807557.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	66	299	6.8e-27	95.2	Protein kinase domain
`XP_057807557.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	66	301	1.7e-29	103.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057807557.1`	Pfam	`PF25575`	TPR_BSK1_C	Repeat	338	455	1.2e-53	180.7	Serine/threonine-protein kinase BSK1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951573.1
CACACACACACACAAAAAGGTACACTTTTTCACGCATAATGAGCACACACACACTGGTGCAGCTGCAGTATGAAAATGCAACAAAACAAACAACCAAAGCTCTCTCTCTCTTCTTTCTCTCTCTCTCTTCACGTGCCAATCATCGACTTATCATGTGACTGCCTTCACTGCTCAGCTCTTGGTGCTGCAATCAACCCCCTTCACACACACACACACACACACACACAAACACAAACACACGCTTCGAGCTCTCTTCTTGC...

XM_057951574.1
ACACACACACACAAAAAGGTACACTTTTTCACGCATAATGAGCACACACACACTGGTGCAGCTGCAGTATGAAAATGCAACAAAACAAACAACCAAAGCTCTCTCTCTCTTCTTTCTCTCTCTCTCTTCACGTGCCAATCATCGACTTATCATGTGACTGCCTTCACTGCTCAGCTCTTGGTGCTGCAATCAACCCCCTTCACACACACACACACACACACACACAAACACAAACACACGCTTCGAGCTCTCTTCTTGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022155
ATGGGCTGTTTGCAGTCCAAAACTGCCAATGTCCAGTCCCCTGACCAAGAACCCTCACACCCCGACTCCAAACCAGATCTAGATCCAGATCAAGTGCCTGCATTCAAGGAATTTGGGCTTGCTGAACTACGTGCTGCGACGAATGGTTTTAGCAGCGAGCTTATAGTTTCTGAGAGTGGAGAGAAAGCTCCTAATGTTGTCTATAGGGGTAAGATCCGAAGCAACCACCTAGTTGCGATCAAGCGCTTCTCAAAGCAGTC...

LOC131022155
ATGGGCTGTTTGCAGTCCAAAACTGCCAATGTCCAGTCCCCTGACCAAGAACCCTCACACCCCGACTCCAAACCAGATCTAGCAAATGGGGACCAAGTAGATCCAGATCAAGTGCCTGCATTCAAGGAATTTGGGCTTGCTGAACTACGTGCTGCGACGAATGGTTTTAGCAGCGAGCTTATAGTTTCTGAGAGTGGAGAGAAAGCTCCTAATGTTGTCTATAGGGGTAAGATCCGAAGCAACCACCTAGTTGCGATCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807556.1
MGCLQSKTANVQSPDQEPSHPDSKPDLANGDQVDPDQVPAFKEFGLAELRAATNGFSSELIVSESGEKAPNVVYRGKIRSNHLVAIKRFSKQSWPDARQFMAEAAGVGKVRHKRLVNLIGCCAEGDERLLVAEYMPNDTLSKHLFHWDKQPLPWEMRVRVAYHIAQALDHLNAENRKIYHDLNAYRILFDEEGDPRLSTFGLMKNSRDGKSYSTNLAYTPPEFLRTGRVIPESVIYSYGTVLLDLLSGKHIPPSHALDII...

XP_057807557.1
MGCLQSKTANVQSPDQEPSHPDSKPDLDPDQVPAFKEFGLAELRAATNGFSSELIVSESGEKAPNVVYRGKIRSNHLVAIKRFSKQSWPDARQFMAEAAGVGKVRHKRLVNLIGCCAEGDERLLVAEYMPNDTLSKHLFHWDKQPLPWEMRVRVAYHIAQALDHLNAENRKIYHDLNAYRILFDEEGDPRLSTFGLMKNSRDGKSYSTNLAYTPPEFLRTGRVIPESVIYSYGTVLLDLLSGKHIPPSHALDIIRGKNVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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