当前解析结果
SmilChr04G000233| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000233 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000233 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000233 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 2072752 - 2073555 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022162 |
|---|---|
| GeneID | 131022162 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022162 |
| 原始查询 | LOC131022162 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820175]; symbol=AT3G10120; hit=AT3G10120; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820175]; symbol=AT3G10120; hit=AT3G10120; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G10120 (AT3G10120)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820175] identity=29.6; qcov=1.37; evalue=3.31e-12; confidence=low |
| Rice | Os11g0153000- identity=33.8; qcov=1.04; evalue=1.04e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022162 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807570.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057807570.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057807570.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807570.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807570.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:2073079 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 28 | A20,B112,B117,B119,B121,B13,B134,B135,B16,B28,B36,B4,B40,B45,B47,B50,B58,B64,B73,B75,C11,C17,C55,C57,C7,C73,C79,D10 |
Chr4:2073215 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 27 | A2,A23,A4,B1,B10,B109,B110,B140,B15,B3,B30,B54,B71,B88,B97,C13,C14,C23,C36,C43,C55,C62,C65,C71,C76,D10,D9 |
Chr4:2073450 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。