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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000238`

染色体: Chr04 坐标: 2137979-2141645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000238`
名称	SmilChr04G000238
描述	alpha-soluble NSF attachment protein-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2137979 - 2141645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022165`
GeneID	`131022165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022165`
原始查询	`LOC131022165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-soluble NSF attachment protein-like
产物	alpha-soluble NSF attachment protein-like
Arabidopsis	`AT3G56190` (ALPHA-SNAP2) alpha-soluble NSF attachment protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824785] identity=75.4; qcov=1; evalue=1.35e-149; confidence=high
Rice	`Os08g0282400` - identity=68.2; qcov=1; evalue=8.42e-147; confidence=high
GO	GO:0005483 (soluble NSF attachment protein activity); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0019905 (syntaxin binding); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0035494 (SNARE complex disassembly)
KEGG	-
Pfam	PF14938 (SNAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807572.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807572.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057807572.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057807572.1`
5	Midbody	Midbody	0.40000	`XP_057807572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2139089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C53,C86
`Chr4:2140380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A9,B119,B21,B87
`Chr4:2140380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B119,B21,B87
`Chr4:2140445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:2140448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:2140603`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B106,B66,B70,C37,C38,C62,C72,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807572.1

289 aa

144

289

SNAP

PF14938 SNAP 7-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807572.1`	Pfam	`PF14938`	SNAP	Repeat	7	278	4.2e-110	368.4	Soluble NSF attachment protein, SNAP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951589.1
ATGCAAATGCATAGGAAAACCGAACTTACTATTTATGCCAAATTATATTACCAAATATAGCATAAACTAAAATAGAGGAGTATTTTTTTTTCTTTTGATGTGAAATACAGAATTTGGTCGACATATGAATGGATTCAGCAAAGAATGAATGGTGTTTTCTGATATCGTTGCGCCCCCAAATTCCATTAATTTCTGGTTTCGTTCCTGCAAAAAAGCGACGACAGGAAAATATCGCGTGAAGAAGAAGAAGAAGAGTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022165
ATGGGCGATCATTTGGCGAGGGCCGAGGACTTCGAGAGCCGAGCCGAGAAGAAACTCGGTGGCTGGGGCTTATTCGGCTCCAAATACGAAGACGCTGCCGACTTATTCGACAAAGCCGCCAACGCTTTCAAGCTTTCCAAATCATGGGATCGAGCAGGAGCAGTATATGTCAAGTTGGCTAACTGTCACCTGAAGTTAGATAGCAAGCATGAAGCTGCTAATGCGTATGCTGATGCAGCTCATTGCTACAAAAAGTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807572.1
MGDHLARAEDFESRAEKKLGGWGLFGSKYEDAADLFDKAANAFKLSKSWDRAGAVYVKLANCHLKLDSKHEAANAYADAAHCYKKCNIQESISCLEESVNIFLDIGRFNMSARYYKEIAELYEQEQNLEQAIVYFEKAVDLFQSEEVSTSANQCKQKVAQYAAQLEQYQKAIEIYEEIAQQSLNNNLLKYGVKGHLLNAGICQLCKADFVAINKALERYQDLDPTFSGTREYKLLADLAAAIDEEDLTKFTDAVKEYDSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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