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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000255`

染色体: Chr04 坐标: 2316991-2322331 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000255`
名称	SmilChr04G000255
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2316991 - 2322331 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022179`
GeneID	`131022179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022179`
原始查询	`LOC131022179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit-like
产物	serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit-like
Arabidopsis	`AT2G42500` (PP2A-3) protein phosphatase 2A-3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818850] identity=93; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0805300` (OsPP56) - identity=96.4; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0070262 (peptidyl-serine dephosphorylation)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807592.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807592.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057807593.1`
4	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057807593.1`
5	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057807593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2317513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B115,B23
`Chr4:2317517`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A15,B52,D7
`Chr4:2317517`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A15,B52,D7
`Chr4:2317518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C77
`Chr4:2317542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B5
`Chr4:2317562`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B115,B23
`Chr4:2317562`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B115,B23
`Chr4:2317973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr4:2318022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr4:2318032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2318065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B128,B51,B69
`Chr4:2318113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807592.1

323 aa

162

323

Metallophos

PF00149 Metallophos 55-248 aa

XP_057807593.1

313 aa

156

313

Metallophos

PF00149 Metallophos 55-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807592.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	55	248	1.2e-46	160.4	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057807593.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	55	248	1.1e-46	160.5	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951610.1
TTGTTGGTGGAAAATTTAGAAATTCAAAATTTGAAGGTGTGGAGTGTGGACTGTGGAGTGGTGGTATCGCCAGGTTAAACATAACTGGAGAAGAGGTTAAAAACAAGGTTTAGATAAGAAACAAAGTTAAGCACTTCATCAAAATCAAAATTCAAAAATAATTAGTAGAAAAATAGTGGTAGATCGATTATTTTTTTATTTTCTCTCTTCCCCCTCGGTTCCACCATTTCCATCCACTCGCACTCTTCGCGAGTTCTCGT...

XM_057951609.1
TTGTTGGTGGAAAATTTAGAAATTCAAAATTTGAAGGTGTGGAGTGTGGACTGTGGAGTGGTGGTATCGCCAGGTTAAACATAACTGGAGAAGAGGTTAAAAACAAGGTTTAGATAAGAAACAAAGTTAAGCACTTCATCAAAATCAAAATTCAAAAATAATTAGTAGAAAAATAGTGGTAGATCGATTATTTTTTTATTTTCTCTCTTCCCCCTCGGTTCCACCATTTCCATCCACTCGCACTCTTCGCGAGTTCTCGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022179
ATGAGCGCGGATCTGGTGGCGGAGAACACACATGGGAATCTGGACGAGCAGATTGCCCAGCTCAATCAGTGCAAGCCTTTATCAGAGCCCGAGGTTAGGGCCTTGTGCGAGAAGGCTAAGGAGATACTAATGGAGGAAAGTAATGTTCAGCCAGTGAAAAGCCCTGTGACGATTTGTGGTGATATTCACGGTCAATTTCATGATCTTGCCGAACTATTCCGCATTGGAGGGAAGTGTCCAGACACAAACTATCTATTCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807592.1
MSADLVAENTHGNLDEQIAQLNQCKPLSEPEVRALCEKAKEILMEESNVQPVKSPVTICGDIHGQFHDLAELFRIGGKCPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPQRITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKIFTDLFDYFPLTALVESEIFCLHGGLSPSVETLDNIRNFDRVQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRCGWGISPRGAGYTFGQDISEQFNHSNNLKLIARAHQLVMEGYNWAHEQKV...

XP_057807593.1
MSADLVAENTHGNLDEQIAQLNQCKPLSEPEVRALCEKAKEILMEESNVQPVKSPVTICGDIHGQFHDLAELFRIGGKCPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPQRITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKIFTDLFDYFPLTALVESEIFCLHGGLSPSVETLDNIRNFDRVQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRCGWGISPRGAGYTFGQDISEQFNHSNNLKLIARAHQLVMEGYNWAHEQKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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