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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000266`

染色体: Chr04 坐标: 2421299-2425399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000266`
名称	SmilChr04G000266
描述	protein spt2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2421299 - 2425399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022187`
GeneID	`131022187`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022187`
原始查询	`LOC131022187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein spt2-like
产物	protein spt2-like
Arabidopsis	`AT4G37860` (AT4G37860) SPT2 chromatin protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829942] identity=43.4; qcov=0.363; evalue=3.86e-27; confidence=low
Rice	`Os02g0664400` - identity=30.2; qcov=0.993; evalue=2.14e-27; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF08243 (SPT2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022187

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807604.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057807604.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807604.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807604.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2422357`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr4:2422357`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr4:2423725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr4:2423732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C51
`Chr4:2423733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B23
`Chr4:2423926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr4:2423965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D11
`Chr4:2424112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:2424130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr4:2424302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2424949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B38,C28
`Chr4:2424949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807604.1

457 aa

228

457

SPT2

PF08243 SPT2 372-449 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807604.1`	Pfam	`PF08243`	SPT2	Domain	372	449	1.6e-16	61.5	SPT2 chromatin protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951621.1
GAGGCGAGTAAACTCCCGATGAGAATGAAGAATGAAGAATGAAAAAGGAAAATGAAAATTGCAGTCACTCTTCTTGTTTCTACAGCCGCTGTTCATCTCAAGTTCTCCTGCTCTCTCGCACCCCGCCTCCCCCTGCCCAAGCGCTCGCCGCCGCGCCTCGTCGCCCACTGCCTAGCATCCTGCAGCCTCATCTCTGGACTTTCTCTTTCGCGTGGGCGCCGCCTCTGCAGAGCAGCAGATACCAGGATTGGGGATTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022187
ATGCGAGGGTATGAAAAAGATGAGTATGAAGATTGGGATGAGTATGAGGAAGATGGAGAGGAGCAAGAAGTGGAAGAAGGTGATGATGAAGTTCATCAGCCCACCCAGGAGGAGTTGGATTATCTTGCTATCAGGCAAAAGTTAAAAGAAAAATTCAGAAAGAAGATGATGAAGGATACAAGGACTGCAAACCCTAGTTCCCGTGACAAAGTGAATGCATCACGTAAAGACAACTATGGTTCTTTCTTTGGGCCTTCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807604.1
MRGYEKDEYEDWDEYEEDGEEQEVEEGDDEVHQPTQEELDYLAIRQKLKEKFRKKMMKDTRTANPSSRDKVNASRKDNYGSFFGPSQPVIAQRVIQESKSLLENPELAARICKTSHKEKKSSVSVSAPVSSKSQANRPPSIKKKAEMLKNTRDYSFLLSEDAEVPASTKGPPPRNVSAPKSDARSAEPMPRSRPVVNGRGREVSNGRDGRKPTLPCSQSKSKVGMDKLAQTKKPSTESRKQFGNNSGSGPGRPLGPKVAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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