当前解析结果
SmilChr04G000270| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000270 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000270 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000270 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 2468249 - 2469630 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022190 |
|---|---|
| GeneID | 131022190 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022190 |
| 原始查询 | LOC131022190 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022190 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807610.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057807610.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057807610.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807610.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807610.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:2469028 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr4:2469029 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B82,B84,C34,D4 |
Chr4:2469052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr4:2469095 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 80 | A20,A21,A24,A5,A7,B10,B101,B102,B105,B109,B11,B111,B113,B115,B118,B120,B123,B129,B132,B133,B134,B139,B15,B19,B20,B24,B28,B32,B34,B35,B37,B41,B42,B44,B45,B49,B63,B65,B69,B70,B73,B77,B79,B8,B83,B86,B89,B91,B98,B99,C1,C10,C13,C16,C21,C22,C25,C27,C28,C3,C35,C36,C37,C39,C5,C51,C52,C58,C6,C61,C65,C72,C74,C78,C87,D11,D2,D5,D6,D8 |
Chr4:2469099 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | B10,B106,B108,B125,B13,B15,B17,B19,B22,B36,B38,B39,B48,B63,B70,B74,B81,B90,B92,B94,B95,B97,C12,C28,C39,C45,C56,C76,C79,D7 |
Chr4:2469103 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A1,A14,A25,B21,B59,C5 |
Chr4:2469135 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B49,C79,D7 |
Chr4:2469136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr4:2469166 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr4:2469167 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B51,C35,C48,C86,C9 |
Chr4:2469169 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | C56,C70,D11 |
Chr4:2469169 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C56,C70,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。