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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000398`

染色体: Chr04 坐标: 4111781-4117079 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000398`
名称	SmilChr04G000398
描述	uncharacterized SmilChr04G000398
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4111781 - 4117079 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022228`
GeneID	`131022228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022228`
原始查询	`LOC131022228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FMN-linked oxidoreductases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825526]; symbol=AT3G63510; hit=AT3G63510; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FMN-linked oxidoreductases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825526]; symbol=AT3G63510; hit=AT3G63510; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G63510` (AT3G63510) FMN-linked oxidoreductases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825526] identity=70.6; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0278900` - identity=68.7; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002943 (tRNA dihydrouridine synthesis); GO:0017150 (tRNA dihydrouridine synthase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF01207 (Dus)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807671.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807673.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807671.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807671.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4112647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B76
`Chr4:4113457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B7
`Chr4:4113497`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A2,B103,B108,B112,B124,B134,B135,B140,B22,B24,B26,B32,B41,B42,B87,B92,C43,C48,C49,C54,C58,C63,C7,C76,C78,C8,C82,C85,D9
`Chr4:4113692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:4115628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:4115904`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	81	A1,A11,A2,A21,B1,B100,B101,B103,B108,B112,B114,B117,B119,B124,B125,B132,B133,B134,B135,B137,B140,B16,B17,B22,B24,B26,B27,B30,B32,B35,B41,B42,B43,B47,B49,B5,B50,B54,B56,B58,B59,B63,B65,B75,B77,B79,B86,B87,B9,B90,B92,B95,B96,C1,C20,C23,C25,C34,C4,C43,C45,C46,C48,C49,C54,C58,C59,C60,C63,C7,C76,C77,C78,C8,C82,C85,C87,D11,D2,D4,D9
`Chr4:4115933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807671.1

430 aa

215

430

Dus

PF01207 Dus 69-377 aa

XP_057807672.1

430 aa

215

430

Dus

PF01207 Dus 69-377 aa

XP_057807673.1

374 aa

187

374

Dus

PF01207 Dus 13-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807671.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	69	377	1.3e-58	199.3	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057807672.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	69	377	1.3e-58	199.3	Dihydrouridine synthase (Dus)
`XP_057807673.1`	Pfam	`PF01207`	Dus	Domain	13	321	8.5e-59	199.9	Dihydrouridine synthase (Dus)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951688.1
GTAAGAAAAGTGCGATGAATGAAATCCCTTTTAAAAAAGTCAAATGCATTTTGCCTAAAAACAGAATAAATCGAACAATTAGGGTTCCTACCCTTTAAATATTAATAATAATAATAATAAAAACAGAATAATTTGCTTGGGGAAACTTCATAATCGTTTTCTGGAATTGTATGATAATTGATAAACCCACAAATTTGTGGTGCCTACGTTTCCGAATCCAGTGCTAAAGAAAAAGGGGAGAAACCCAAATTCCTGTATAG...

XM_057951690.1
TAAGAAAAGTGCGATGAATGAAATCCCTTTTAAAAAAGTCAAATGCATTTTGCCTAAAAACAGAATAAATCGAACAATTAGGGTTCCTACCCTTTAAATATTAATAATAATAATAATAAAAACAGAATAATTTGCTTGGGGAAACTTCATAATCGTTTTCTGGAATTGTATGATAATTGATAAACCCACAAATTTGTGGTGCCTACGTTTCCGAATCCAGTGCTAAAGAAAAAGGGGAGAAACCCAAATTCCTGTATAGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022228
ATGATCAAGTGTACCGGCCATATTTTGTCTACTTCTTTAACTCCTGTTCCTTCTCTTGTCCTGAAAAACCATGGCAGATTGTTTTCCAACTTAAATTATACAAATTTGACCAAATCAAGGAAATTGCATCGCTACGTTCAGAAGTGCCAGTTTCACAAGGAGAGCATTATGGTGGCCACCCGCTATCCTCCGCCTTGGTTCAGTATTGCTCCAATGATGGACTTAACGGACAACCACTATAGAACTTTGGCTCGTATCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807671.1
MIKCTGHILSTSLTPVPSLVLKNHGRLFSNLNYTNLTKSRKLHRYVQKCQFHKESIMVATRYPPPWFSIAPMMDLTDNHYRTLARIISKEAWLYSEMIAAETIVFQKGNLDRFLAFGPEQHPIVLQIGGNDLENIAKATQLANPYGYDEINFNCGCPSPKVAGKGCFGVRLMLDPKFVADAMSVISANTNVPVSVKCRIGVDDHDSYNELCDFIYKVSSQSPTRHFIIHSRKALLNGISPRENRSIPPLKYEFFYALLRD...

XP_057807672.1
MIKCTGHILSTSLTPVPSLVLKNHGRLFSNLNYTNLTKSRKLHRYVQKCQFHKESIMVATRYPPPWFSIAPMMDLTDNHYRTLARIISKEAWLYSEMIAAETIVFQKGNLDRFLAFGPEQHPIVLQIGGNDLENIAKATQLANPYGYDEINFNCGCPSPKVAGKGCFGVRLMLDPKFVADAMSVISANTNVPVSVKCRIGVDDHDSYNELCDFIYKVSSQSPTRHFIIHSRKALLNGISPRENRSIPPLKYEFFYALLRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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