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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000315`

染色体: Chr04 坐标: 2893813-2896935 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000315`
名称	SmilChr04G000315
描述	uncharacterized SmilChr04G000315
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2893813 - 2896935 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022234`
GeneID	`131022234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022234`
原始查询	`LOC131022234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834853]; symbol=AT5G48020; hit=AT5G48020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834853]; symbol=AT5G48020; hit=AT5G48020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G48020` (AT5G48020) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834853] identity=75.4; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0717500` - identity=74.7; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807680.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807680.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057807680.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807680.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807680.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2894048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr4:2894048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:2894062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:2894179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B62,C28,C9,D2
`Chr4:2895188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B70,C13
`Chr4:2895220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:2895618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:2895924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B135,C15
`Chr4:2895926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B25,B53,C5,C83
`Chr4:2895931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B70,C13,C23
`Chr4:2896423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:2896482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951697.1
TAATAATTTAAATACAATTTTAGTCTCCCGCCATCACCATTTCACCAAACAAAATTAGGAATCCACTACCCCACCATTTCCAATCCCAAAAACTTTCTCTTTCTCTCTCTAAAACTCAGCTATGCAGATTCCGGTGATCGATCTGGCGCCCTACTTGGAATTCTCCGCGAATTCTCCGAGCCCGGGCAAGGAGGAGCCCGATTCGAATCTGAAGACTCTGTGCTCGGAAGTCAGCCGAACCCTAAGAGAGACGGGAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022234
ATGCAGATTCCGGTGATCGATCTGGCGCCCTACTTGGAATTCTCCGCGAATTCTCCGAGCCCGGGCAAGGAGGAGCCCGATTCGAATCTGAAGACTCTGTGCTCGGAAGTCAGCCGAACCCTAAGAGAGACGGGAGCTCTGCTTGTTAAGGATCCGCGATGCTCCGCCGCAGACAACGATCGCTTTCTCGACATGATGGAGAAGTATTTTGAAATGCCCGATGATTTCAAGCGCCGCCAGGAGCGCCCGCAGCTCCATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807680.1
MQIPVIDLAPYLEFSANSPSPGKEEPDSNLKTLCSEVSRTLRETGALLVKDPRCSAADNDRFLDMMEKYFEMPDDFKRRQERPQLHYQVGVTPEGVEVPRSLVDEEMQEKLRSMPVESQPSNPAGPDPKWRYMWRVGPRPSSTRFKELNSEPVIPEGFPVWKDTMDSWGYKMVSAIEVVAEMAAVGFGLQKDAFTSLMNQGPHLLAPTGSNLKRHGQIGTVFAGYHYDLNFLTIHGRSRFPGLNIWLRNGQKMEVKVPVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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