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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000294`

染色体: Chr04 坐标: 2738606-2746974 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000294`
名称	SmilChr04G000294
描述	uncharacterized CRM domain-containing protein At3g25440, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2738606 - 2746974 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022236`
GeneID	`131022236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022236`
原始查询	`LOC131022236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0304500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0304500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G13070` (AT4G13070) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826921] identity=61.9; qcov=0.987; evalue=2.25e-121; confidence=high
Rice	`Os06g0304500` - identity=71.8; qcov=0.809; evalue=1.66e-124; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807684.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807684.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807684.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807684.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2738956`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A2,B1,B106,B125,B129,B130,B25,B33,B38,B39,B4,B40,B51,B53,B62,B63,B83,B99,C13,C14,C16,C24,C4,C48,C63,C79,C82,D11,D2,D3,D4,D9
`Chr4:2738989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:2739027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr4:2739703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B49,B79,C18
`Chr4:2739752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:2739935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B60
`Chr4:2744950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B122,B137
`Chr4:2744966`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr4:2744966`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr4:2745008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:2745260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:2745263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807684.1

353 aa

176

353

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 209-293 aa

XP_057807685.1

353 aa

176

353

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 209-293 aa

XP_057807686.1

303 aa

152

303

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 159-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807684.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	209	293	2.5e-18	66.9	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057807685.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	209	293	2.5e-18	66.9	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057807686.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	159	243	1.6e-18	67.5	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951701.1
AAAAATTAATCACATCCGAAGCCCATGAACTCTCTTACACAAACAAAGCCCAATTATGCATACTATAAATACCTAAATCTTCAAATCTTCTTCCTCCACCACCGATTTCAAACTTCACCTCACACTAAATACTTCTCTCCGTCGCCCAAGAGCCCATCCCAGTCGTCGCCTAGGCCTAATCCCCTCGCCTTTACAGCCGTCGCCTTTCATCTTCGCCAGCCCCTGCTGTAACCCACCCCGCACCCTGCCAAACCCACCCC...

XM_057951702.1
CTTCTTCCTCCACCACCGATTTCAAACTTCACCTCACACTAAATACTTCTCTCCGTCGCCCAAGAGCCCATCCCAGTCGTCGCCTAGGCCTAATCCCCTCGCCTTTACAGCCGTCGCCTTTCATCTTCGCCAGCCCCTGCTGTAACCCACCCCGCACCCTGCCAAACCCACCCCTGCGCAACCCCTCTCGCTGCTCGCTGTCGCGCCGCCCTGCGCCACCCCGCCATCGCCGCCCTCGGAGCAATCGCGCCACCCTGCCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022236
ATGCCAAGAGCTTCCTTATCAGGGCTCCCACTCACCATATTCACCAACACCACTATGCGACCTATTACCAGAAGGGAGTCTGTGCTTGGTTCCAAATGCTCATTGAGAAGCATTTTAACACCTCCTCATTCGACGTTTCTGCTGCGTTTTATGCATCATTTTGGGTGCAGAAACGAAGGGGTGCATCATTCAAAGAAACCGCTACCCCTTTTCTCATTTAGAGCGATCTCAGTGAATGCTTTATCTGTTAAAAGATCATG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807684.1
MPRASLSGLPLTIFTNTTMRPITRRESVLGSKCSLRSILTPPHSTFLLRFMHHFGCRNEGVHHSKKPLPLFSFRAISVNALSVKRSCTIGPWSSCLVREYAKVRTNESIEMKMDEDVIRFKIGDQSQEGTSLNKRKAMTKKSDVSRKAKLNELRFYRLKAKKKMNSPNPEVRIRYKLEKAKRKEAWLIEKLRKYELPKAALETYDPEILTAEERFYLKRTGEKKKHYVPVGRRGVFGGVVLNMHLHWKKHETVKVICKPC...

XP_057807685.1
MPRASLSGLPLTIFTNTTMRPITRRESVLGSKCSLRSILTPPHSTFLLRFMHHFGCRNEGVHHSKKPLPLFSFRAISVNALSVKRSCTIGPWSSCLVREYAKVRTNESIEMKMDEDVIRFKIGDQSQEGTSLNKRKAMTKKSDVSRKAKLNELRFYRLKAKKKMNSPNPEVRIRYKLEKAKRKEAWLIEKLRKYELPKAALETYDPEILTAEERFYLKRTGEKKKHYVPVGRRGVFGGVVLNMHLHWKKHETVKVICKPC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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