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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001964`

染色体: Chr01 坐标: 34969412-34971297 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001964`
名称	SmilChr01G001964
描述	uncharacterized SmilChr01G001964
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34969412 - 34971297 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022239`
GeneID	`131022239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022239`
原始查询	`LOC131022239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03318 (ETX_MTX2); PF07468 (Agglutinin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057807692.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057807692.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807692.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807692.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34969641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:34969713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C39
`Chr1:34969722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:34969868`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C29
`Chr1:34969868`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C29
`Chr1:34969970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:34970064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B121
`Chr1:34970243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B121,B122,B23,B40
`Chr1:34970289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B46,B59
`Chr1:34970352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:34970376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:34970681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807692.1

472 aa

236

472

Agglutinin

ETX_MTX2

PF07468 Agglutinin 4-116 aa PF07468 Agglutinin 167-287 aa PF03318 ETX_MTX2 312-430 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807692.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	4	116	7e-29	101.7	Agglutinin domain
`XP_057807692.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	167	287	7e-29	101.7	Agglutinin domain
`XP_057807692.1`	Pfam	`PF03318`	ETX_MTX2	Family	312	430	2.1e-05	25.2	Clostridium epsilon toxin ETX/Bacillus mosquitocidal toxin MTX2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951709.1
GGTTCAGAACAATGGTCCATTGGTCCATATCCACATGCCAAAAACGTGGCGTACAATAATTGCATGCATCGTCTATTTTGCACGCAGAAATTAGAAAAGGAAAACAGTTTTTTTTTTAATATTTTTGTGTTTGGTGTATGATGATCTATAAATAGAGGTGGAGAAGAACACAATTAAGTAAGTATAACAGCATCTGCTTAAGAAGAAAACGAGAGCAGCAATGGCAGCGGAGCTTCCAAATTTCATCGTGCTGAGGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022239
ATGGCAGCGGAGCTTCCAAATTTCATCGTGCTGAGGGCAACCGCCCATCAGCGGTACGTGTCGTACTACAAGGAAGAAGGCCCCCAGAAAGGGTGGGTGACCGCCGAGGTGGAGGACGTGTTCAGCCCACTGGTGAAGATCCAAGTGGAGCCCTCCAAAAGCGACGAGCGCTTCGTTCACTTCCGCTTCGTCCACACCAACAAGTACATAGCTCGAAGCAACAACTCCCAGCAGCTCATCGCAGTCGCTGACCAGCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807692.1
MAAELPNFIVLRATAHQRYVSYYKEEGPQKGWVTAEVEDVFSPLVKIQVEPSKSDERFVHFRFVHTNKYIARSNNSQQLIAVADQPEEDLSKPTCTLFEPVFTPATNALALRHVQSNRRVDVLSLTFNPPLAPRLICLITRFATNELPPSDHYQFIDWDTLIILPRHVAFKGHNDKYLRSLTFQNFPYQQLSADDPNATDTGFEVHTMLDGHVRIKSLHFDRFWRRSPNWIWADNNDANSTHADTLFWPVKIDDNTIALR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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