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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000297`

染色体: Chr04 坐标: 2766393-2768271 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000297`
名称	SmilChr04G000297
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2766393 - 2768271 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022247`
GeneID	`131022247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022247`
原始查询	`LOC131022247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20-like
产物	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20-like
Arabidopsis	`AT3G50310` (MAPKKK20) mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824193] identity=44.6; qcov=0.927; evalue=1.57e-75; confidence=medium
Rice	`Os02g0322400` - identity=38.5; qcov=0.927; evalue=3.28e-48; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807698.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807698.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807698.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807698.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2766444`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A18,A23,B117,B128,B16,B51,B69,B75,B88,B89,C30,C63
`Chr4:2766447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2766451`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A2,B106,B25,B51,B72,B84,C4,D2
`Chr4:2766507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2766531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:2766574`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A16,D7
`Chr4:2766574`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A16,D7
`Chr4:2766687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr4:2766725`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B138,B25,C5,C83
`Chr4:2766725`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B138,B25,C5,C83
`Chr4:2766789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:2766835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807698.1

300 aa

150

300

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 6-268 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 8-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807698.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	6	268	2.6e-50	172.0	Protein kinase domain
`XP_057807698.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	8	263	1.7e-28	100.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951715.1
TTGAGAGAGAGATTAATAATTTAATTGGGTGATGAAGATGCATTGGACAAGAGGCGAAACCCTGGGAGCCGGTGGTTTTGGGTTTGTGTCGATCGCTAAGACCCACCAAGAAGGCGGCGGCAATCCCAATATCCCGGCGGTGGTGGCCGTGAAATCGGCCATAGTTTCGCAGTCGAAGTCTCTTCAGAAGGAGAAGGAGCTGCTGAAGAAGTTGGAGGGATGCCCCTGCATCCTCCGCTGCTTCACCGACCAATTCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022247
ATGAAGATGCATTGGACAAGAGGCGAAACCCTGGGAGCCGGTGGTTTTGGGTTTGTGTCGATCGCTAAGACCCACCAAGAAGGCGGCGGCAATCCCAATATCCCGGCGGTGGTGGCCGTGAAATCGGCCATAGTTTCGCAGTCGAAGTCTCTTCAGAAGGAGAAGGAGCTGCTGAAGAAGTTGGAGGGATGCCCCTGCATCCTCCGCTGCTTCACCGACCAATTCACCACCGAGAATTGCCAGAATCTATACAACATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807698.1
MKMHWTRGETLGAGGFGFVSIAKTHQEGGGNPNIPAVVAVKSAIVSQSKSLQKEKELLKKLEGCPCILRCFTDQFTTENCQNLYNIILEYAPGGCLADLIGKGLPEHVVSRHTKSLVTALIHIHKHGYVHCDVKPHNVLLVGHDSKLADFGSCKRIGSVEDDDDEQQQGFRGTVLYAAPESISRQEYTAASDVWALGCTVLHMLTGKAPWKFGKDAAATDVLMKIGCSNEIPAIPKVSEEAKDFLRKCFVKDPTARWKAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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