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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000320`

染色体: Chr04 坐标: 2920945-2921988 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000320`
名称	SmilChr04G000320
描述	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2920945 - 2921988 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022255`
GeneID	`131022255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022255`
原始查询	`LOC131022255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
产物	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
Arabidopsis	`AT1G18250` (ATLP-1) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838405] identity=56.3; qcov=0.925; evalue=4.89e-87; confidence=high
Rice	`Os06g0691200` - identity=56.1; qcov=0.95; evalue=7.25e-85; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057807710.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057807710.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057807710.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807710.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807710.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2921158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:2921179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B7,B96,D6
`Chr4:2921201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C76
`Chr4:2921219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B62,B64
`Chr4:2921244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr4:2921449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C33,C62
`Chr4:2921588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B83,C11,C69,C79
`Chr4:2921612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B7,B96,D6
`Chr4:2921750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:2921815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C5,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807710.1

240 aa

120

240

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 28-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807710.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	28	240	7.2e-81	271.5	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951727.1
CCAAACACAAAAGGTTAAAAACAATTATTGCAATTTGCAACCAACTATATATATTTTGCTCAACTGAAAGTGAATCTGATTCATCACAATGGTATCATCATGGCTTCTTTTCCTAGGCTCACTTCTTCCATTCTTCACAGGATCCAAAGCTGCAGTCTTCACGTTGCAAAACAGGTGTAAAGAAAATATATGGCCCGGAACCCTCTCGGGAGCCGGCCACCCTCTGCTCATAAACGGCGGCCTGCAGCTCAAACCAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022255
ATGGTATCATCATGGCTTCTTTTCCTAGGCTCACTTCTTCCATTCTTCACAGGATCCAAAGCTGCAGTCTTCACGTTGCAAAACAGGTGTAAAGAAAATATATGGCCCGGAACCCTCTCGGGAGCCGGCCACCCTCTGCTCATAAACGGCGGCCTGCAGCTCAAACCAAATGAGCGAACCAACGTCGTAGCACCCACCGGGTGGTCGGGCCGTTTCTGGGCCCGCAGCGGCTGCAGCTTCGACCAATCGGGCAAGCAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807710.1
MVSSWLLFLGSLLPFFTGSKAAVFTLQNRCKENIWPGTLSGAGHPLLINGGLQLKPNERTNVVAPTGWSGRFWARSGCSFDQSGKQGNCTTGDCGGLLQCGGIGGTPPASLAEFTLDSPEDFYDVSLVDGFNMPISVVPSGGSGNCSAVKCSSNLNLQCPEKLQVRVNDGGETVACKSACLAFDQPQFCCTGAYNNPQICKPSNYSEVFKKACPTAYSYPYDDGTSIFTCKGANYSIIFC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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