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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000337`

染色体: Chr04 坐标: 3116174-3117136 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000337`
名称	SmilChr04G000337
描述	thylakoid lumenal 19 kDa protein, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3116174 - 3117136 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022256`
GeneID	`131022256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022256`
原始查询	`LOC131022256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thylakoid lumenal 19 kDa protein, chloroplastic
产物	thylakoid lumenal 19 kDa protein%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G63540` (AT3G63540) thylakoid lumenal protein (Mog1/PsbP/DUF1795-like photosystem II reaction center PsbP family protein) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922413] identity=75.4; qcov=0.597; evalue=5.87e-79; confidence=medium
Rice	`Os08g0504500` - identity=69.4; qcov=0.736; evalue=1.22e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807711.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057807711.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057807711.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807711.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3116339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr4:3116355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C54
`Chr4:3116425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:3116494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C80,D10
`Chr4:3116515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:3116644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B125,B62,B9,C70
`Chr4:3116740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:3116899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D7
`Chr4:3116976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C33,C62
`Chr4:3116977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807711.1

231 aa

116

231

PsbP

PF01789 PsbP 88-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807711.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	88	228	5.7e-09	36.9	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951728.1
ATAAATAAATAGAAACCACAAATTTTTTTGTATATGAGATGGCAGCCTATGATTGGCCGGTGATGGATAAGGAAACAACAGACAATCATAGAAAACAACACATCCACTTATCACACAGACACCCAACAAATTAACTTCCCCATGGCCACCATTTTCTCCCCCTCCGCCGTCCTCTCCTCCTCCTCCGCCGCCACCAAGGCCAAGCCCCACGTCACCATCCCTCCGTCAAAACCACCAGCCAACAACCTAGCCGCGACCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022256
ATGGCCACCATTTTCTCCCCCTCCGCCGTCCTCTCCTCCTCCTCCGCCGCCACCAAGGCCAAGCCCCACGTCACCATCCCTCCGTCAAAACCACCAGCCAACAACCTAGCCGCGACCTTCGCCGCGACCGCCCTCGCCGCAACCATACTCGCCGCCTCCCCGCCGTCGCTGGCCGAACCCTCCTACAAGCTGTACTACGGCACCGCCGCGAGCGCCGCGAATTACGGCGGATTCGGCGGCAACTCCGACAAGAAGGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807711.1
MATIFSPSAVLSSSSAATKAKPHVTIPPSKPPANNLAATFAATALAATILAASPPSLAEPSYKLYYGTAASAANYGGFGGNSDKKASAEYTYDVPEGWKEKLISKIQKGTNGTDSEFYNPKKKKEREYLTFLDGFPRLAPKDMILNNLALSDVELQDLIAAADNVSSEERKDDKGQTYYVYEIDSVAGHSLISVTCARNKLYAHFVNAPAPDWNRDQETLRHIHHSFRTVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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