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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000612`

染色体: Chr01 坐标: 13514420-13515889 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000612`
名称	SmilChr01G000612
描述	uncharacterized SmilChr01G000612
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	13514420 - 13515889 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022298`
GeneID	`131022298`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022298`
原始查询	`LOC131022298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=37.4; qcov=0.461; evalue=1.51e-45; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022298

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807761.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057807761.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807761.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807761.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:13514481`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,B66,B94
`Chr1:13514481`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A11,B66,B94
`Chr1:13514507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C63,C69
`Chr1:13514574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C40
`Chr1:13514677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A18,A19,A7,B1,B101,B104,B109,B11,B129,B130,B134,B140,B15,B32,B48,B49,B6,B66,B67,B69,B7,B72,B83,B84,B87,C1,C10,C29,C31,C36,C41,C42,C45,C48,C53,C59,C79,D3,D5
`Chr1:13514680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C42,D2
`Chr1:13514707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B108,B130,B136,B55,B85,C14,C23,C47,C87
`Chr1:13514737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B69,C6
`Chr1:13514833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,B80,C22,C40,C74
`Chr1:13514835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C42
`Chr1:13514840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B66,B94,C33
`Chr1:13514844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C10,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807761.1

464 aa

232

464

DUF7769

PF24964 DUF7769 10-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807761.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	10	64	2.5e-11	43.8	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951778.1
ATGGCAGAATTTAGGGGAAGCAATAAACTAAGTGAAGACAAAAGGAATCAAATAGCACAGTGGCTATTGCAACATAGTTCGAACGGCAAATTGAAGTACGGGGCTAAGCAAGAGGCTGCCAGCTTCTTCAACACCAGTGACAGAACGATCTATACGATCTGGAAGGTGGCAGCGGCGCAGCATGCAGCAGGCATTCCTATCAAATTAAAGAACATGAAAAAAGGGTCAACTCACAAGGACAAATTCAAACTCGATGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022298
ATGGCAGAATTTAGGGGAAGCAATAAACTAAGTGAAGACAAAAGGAATCAAATAGCACAGTGGCTATTGCAACATAGTTCGAACGGCAAATTGAAGTACGGGGCTAAGCAAGAGGCTGCCAGCTTCTTCAACACCAGTGACAGAACGATCTATACGATCTGGAAGGTGGCAGCGGCGCAGCATGCAGCAGGCATTCCTATCAAATTAAAGAACATGAAAAAAGGGTCAACTCACAAGGACAAATTCAAACTCGATGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807761.1
MAEFRGSNKLSEDKRNQIAQWLLQHSSNGKLKYGAKQEAASFFNTSDRTIYTIWKVAAAQHAAGIPIKLKNMKKGSTHKDKFKLDAEKVKSLSVLQRSSIRVMACSLGVSKSLLHTCMKRKELRAHTNSIKPFLTTQNKKARLQWSLSQLSDVSEMGMRKFQTMFNTIHIDEKWFYLTKTKDRYYLMPDEKEPYRSCKSKRFILKIMFVSAIARPIIDEQGNVLFDGKLGIFPFTNEEAAKRNSKNRSKGTMEVKPIPNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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